在生物学研究中，重组蛋白的研究越来越受到关注，而重组蛋白为重要的莫过于表达系统的选择。蛋白表达系统是指用模式生物如细菌、酵母、动物细胞或者植物细胞表达外源基因蛋白的一种分子生物学技术。常见的蛋白表达系统分为原核表达系统和真核表达系统，具体又可以细分多种，每一种有各自的优缺点。在此，小编给家整理了各表达系统间的差异，供家参考。
| 表达系统 | 代表工程菌株 | 特点 | 产量 | 原核生物 | 肠杆菌 | BL21-PET系统 | 具有原核细胞良好的可操作性，成本低，产率高，但不能进行糖基化修饰，胞内分泌形成包涵体，且易产生内毒素。 | 外源蛋白占细菌总蛋白量：胞内表达10%-70%，胞外表达0.3%-4%。 | | 枯草芽孢杆菌 | B．subtilis系统、B. brevis系统 | 细胞壁不含内毒素，很强的胞外分泌蛋白能力，蛋白酶易对目的蛋白降解，重组表达质粒不稳定，真核蛋白分泌量低。 | 外源蛋白占菌体总蛋白量： 10%-30%。 | 真核生物 | 酵母 | 酿酒酵母 | 兼具原核细胞良好的可操作性和真核系统的后加工能力，但存在产量低及过度糖基化等问题。 | 外源蛋白占菌体总蛋白量：约10%。 | | 甲醇营养型酵母 | 巴斯德毕赤酵母 | 第二代酵母表达系统，部分克服了利用酵母表达的过度糖基化缺点，有较好的分泌性，产量较高，但产品结构与天然分子仍有一些差异。 | 外源蛋白占菌体总蛋白量：10%-30%。 | | 昆虫杆状病毒系统 | 病毒：AcNPV、BmNPV 昆虫：sf9细胞 | 具有高等真核生物表达系统的优点，产品的抗原性、免疫原性和功能与天然蛋白质相似，表达水平较高，但其糖基化程度较低，形式较为单一。 | 发酵液中目的产物含量：1-500mg/L。 | | 植物细胞 | 植物根分泌、叶分泌 | 植物易于培养和生产，在基因表达与修饰及安全性方面有特别的，但转基因植物制作费时，表达量较难提高，分离纯化不便。 | 重组蛋白可达到植物总蛋白的4%。 | | 哺乳动物细胞 | CHO、HEK293、COS、BHK、SP2/0、NIH3T3. | 产品的抗原性、免疫源性和功能与天然蛋白质接近，糖基化等后加工准确，表达水平较低。 | 发酵液中的目的产物含量：0.2-200mg/L。 |
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