提供者:北京凡知医学科技有限公司 发布时间:2025/11/10 14:48:46 阅读次数:83次 进入该公司店铺

肠道微生物也就是我们所说的“肠道菌群”,其数量超过人体自身细胞的10倍以上,对营养物质代谢、人体自身发育、免疫及疾病的产生等方面都起到极其重要的作用。很多研究结果都表明肠道微生物和多种疾病发病直接相关,比如癌症、肥胖、神经变性疾病等。
采用高通量测序对样本中微生物的DNA进行测定,通过生信统计分析,进行处理,揭示肠道中微生物的种类以及相对丰度和进化关系;还可以通过实时荧光定量PCR方法,定量的研究肠道菌群,探讨微生物多样性,研究肠道微生物与环境间的相关关系;还可以通过厌氧培养,获得肠道微生物中的菌种,从菌株水平上研究肠道微生物的功能和作用。
寻找疾病组和健康组间肠道菌群的差异:分别采集健康人群和疾病人群的粪便样本,比较健康组和疾病组之间肠道菌群的差异,寻找与疾病相关的marker,这是目前最典型的研究方法;
研究药物或饮食干预群体的肠道菌群:分别采集药物或饮食干预前、后的群体的粪便样本,比较个体在不同干预阶段的肠道菌群的差异;
同一群体、不同生长发育时期的肠道菌群:如分别采集婴儿出生后0个月、4个月、12个月等时间的粪便样本,对婴幼儿的肠道菌群进行研究;
研究某一疾病发生发展进程中的群体的肠道菌群:如分别选择健康人、结直肠腺瘤患者(大部分的结直肠癌由腺瘤演变而来)、结直肠癌患者群体,研究与结直肠癌疾病进程相关的marker;
研究同一群体多个身体部位的微生物:如分别选取同一人群的粪便、唾液、牙菌斑等样本进行关联分析。
粪便是人或动物的大肠排遗物粪便作为肠道微生物的主要载体,其样本的复杂性给核酸提取带来了挑战。粪便的四分之一是水分,其余大多是蛋白质、无机物、脂肪、未消化的食物纤维、脱了水的消化液残余、以及从肠道脱落的细胞和死掉的细菌等。
一般来说,只需提取其中细菌的核酸进行研究,剩余的食物纤维、蛋白质等均会对提取造成干扰,其中食物纤维会增加裂解难度,蛋白质会降低核酸的纯度,影响下游研究的开展。特别是对于高脂饮食习惯的人群,粪便样本中的脂质含量较高,这可能会影响核酸的提取效率和质量。
粪便样本的保存和运输条件也会影响核酸的质量和稳定性。一些专门的样本保存管,可以在室温下长期保存DNA和RNA,简化了样本的收集和处理流程。
根据研究目的和样本特性,可以选择不同的粪便核酸提取方法。常见的提取方法包括酚法、盐析法、离心柱法、磁珠法等。其中,磁珠法因其操作简便、快速、可自动化等优点而被广泛应用。粪便样本中可能含有PCR抑制物,如腐殖酸等,这些物质会影响后续的分子生物学实验。好的提取方法中也通常包含专门设计的缓冲液和吸附材料,能够有效去除样本中的杂质,并提取高质量的DNA或RNA。
提取效率可以通过实时荧光定量PCR (qPCR) 技术来评估。通过比较不同提取方法得到的DNA纯度、浓度以及特定微生物基因组DNA的提取丰度,可以选择最适合特定研究目的的提取方法。
在提取过程中,应避免使用有害化学物质,并确保提取的核酸质量符合下游应用的要求。
总之,粪便核酸提取是一个需要精细操作和严格质量控制的过程。选择合适的提取方法和试剂盒,结合自动化设备,可以有效提高提取效率和核酸质量,为肠道微生物群落的研究提供可靠的基础。

货号:FG1110D
规格:96次/盒
本试剂盒采用独特包埋的磁珠,拥有独特去腐缓冲系统,并有效去除粪便中各种影响下游实验(如PCR)的抑制因子,能够安全、快速分离纯化核酸,提取的基因组DN段大,纯度高,质量稳定可靠。
纯化的基因组可以直接用于PCR、荧光定量PCR、酶切反应、Southern杂交、文库构建、尤其适合高通量测序工作站的自动化提取。
· 易 操 作:即取即用,一步离心即可上机实验。无需加入蛋白酶K,防止加样操作过多造成样本间污染。配备对应的保存液,防止样本降解;
· 安全无毒:无需酚、等有毒试剂;
· 适用性广:适合手工及高通量自动化提取设备;
· 高 质 量:完整性好和纯度高,提取产物无颜色,无掉磁。
分别取人、狗、小鼠粪便样本0.1g进行提取,洗脱体积100μL。进行浓度、纯度等测定,结果如图1所示:


结果显示:产品可适用于各种粪便样本基因组DNA,提取的DN段完整,下游实验结果良好。
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