垂直转子诞生于20世纪70年代，现在高速冷冻离心机和超速离心机大都配垂直转子，其应用广泛。垂直转子梯度离心技术应用很广，它可以用分离且检定各种组织成分。

垂直转子分离时间短。从现有的实验结果来看，比甩开转子缩短离心时间数倍以上。这是由于颗粒区带移动的径向距离短，可以获得最小的k值。因为离心时间短，蛋白质不易失活，所以不稳定蛋白质（如酶类）失活的可能性小。 受管壁效应的影响较小。能够离心较大体积与较多份数的样品。分辨率高。由于在离心过程中样品区带是沿离心管的长度铺开，转子的降速过程中梯度重定向，使区带间距离增大。提供最大的离心力。离心管所插的位置靠近转子的外边缘，与相同直径大小的甩开转子或角转子相比，其最小RCF值也比其他种类转子都大。梯度容量大，垂直转子梯度的横断面积大，所以在梯度上铺放大量样品是可行的。

垂直转子主要用于等密度离心。又由于没有壁效应（至少在梯度的前期），它对速率区带离心也很理想。垂直转子的最小离心加速度与最大离心加速度的差别不大，各种颗粒都处于强离心场中，所以分离快速，分辨率高。