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改良热硼酸盐法提出取得RNA

提供者:上海柏欣仪器设备厂   发布时间:2012/5/22 10:11:49  阅读次数:4714次  进入该公司店铺

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杨**
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(1)取3 g样品,参加10百分之百 样品重的多聚聚乙烯pyrrole烷酮(PVPP),用液氮研磨成齑粉状,将齑粉分为每份约3 g,并储藏于-80℃下。

(2)在50 ml falcon管中参加20 ml提出取得缓和冲突液。提出取得液的组变成0.2 mol/L 脱水四硼酸钠(sodium tetriborate decahydrate)、30 mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)、1百分之百 (W/V)十二烷基硫酸钠(SDS)、1百分之百脱氧气胆酸钠盐。再参加0.0309 g二硫苏糖(DTT)、200 ul乙基苯基聚甘醇(NP-40)和0.4 g聚乙烯pyrrole烷酮(PVP-40),并置于80℃下均衡15 min。抽取于-80℃中保留样品,参加热均衡后的提出取得缓和冲突液,振动混匀。再参加800 ul蛋白酶K(20 mg/ml ),盖好管盖,平放于转速为120 r/min 、温度为42℃摇床上,摇摆提出取得1.5 h。

(3)在这以后,向样品管中加人1.6 ml 2 mol/LKCl,振动混匀,将样品管置于4℃条件下1~1.5h。将提出取得液转移至玻璃离心管中,在4℃条件下以12 000×g离心20 min。取上清液置于新的玻璃离心管中,参加1/4(或1/3)大小8 mol/L LiCl(~20℃),振动混匀,于4℃安放过夜。4℃下以12 000×g离心20 min,去除上清液,RNA沉淀停留不动于管底。参加3~5 ml冷的2 mol/L (4℃)LiCl,轻缓振动,4℃下以12 000×g离心10 min,去除上清液。重复2 mol/L LiCl清洗2~3次,一直到上清中无色素类事物。

(4)用2 ml 10 mmol/L。Tris-HCl(pH 7.5)充分溶解沉淀,4℃下以12 000×g离心10 min,去除不溶性的沉淀,将上清液转移至15 ml玻璃离心管中,参加200 ul(1/10大小)的2 mol/L CH3COOH钾(pH 5.5)。于4℃温浴中放30 min。4℃下以12 000×g离心10 min。将上清液转移至新的玻璃离心管中,参加2.5倍大小的100百分之百 酒精,摇匀并置于-80℃条件下沉降RNA 1~2 h。

(5)4℃下9 800×g离心30 min,去除上清液,RNA沉淀停留不动于管底。用1~2 ml 70百分之百冷酒精(-20℃)清洗沉淀,4℃下9 800×g离心5 min,去除上清液。室温下干燥RNA沉淀(20~30 min)至管内无水珠。

(6)用200 ul通过焦碳酸二酒精(DEPC)处置的超纯水充分溶解沉淀。溶解液绝对转移至1.5ml离心管中,再用100 ul通过DEPC处置的超纯水清洗原管壁和管底,将清洗液合并于RNA溶解沉淀中,参加1/10大小3 mol/L CH3COOH钠(pH5.2)和2.5倍大小的100百分之百 冷酒精,混匀后安放于-20℃沉降RNA 1 h。混合液在4℃下以16 000×g离心30 min,去除上清液,用1~2 ml 70百分之百 冷酒精(-20℃)清洗管底停留不动的RNA沉淀,4℃下以9 800×g离心5 min,去除上清液,RNA沉淀停留不动管底。

(7)RNA沉淀于室温下干燥20~30 min。用数量适宜通过EDPC处置的超纯水(100~300 ul)溶解RNA沉淀,RNA液置于-80℃条件下可长时期保留,或用于剖析。


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