为满足今天实验室所使用的高端分析仪器用水需求，一个典型的纯水系统应该包括以下四个部分：1）纯水制备系统2）纯水储存系统3）纯水分配系统4）超纯水系统
纯水制备系统
纯水制备系统以自来水作为进水，恒温水浴锅制备足量符合实验室所需特定水质的纯水，是实验室整体纯水系统的起点。实验室每天纯水的用量有可能从几升到几千升不等。在设计之处首先应该考虑的是：确定每个用户和每台仪器每天的用水量和所需纯水的水质，以及用水规律。而后纯水设计部门便可以据此计算出整个实验室每天总的用水量以及高峰用水量。
实验室所需的纯水水质也可能各不相同。有可能是常用的二级水（分析级），也有可能三级水（实验级）或者是满足特殊应用需求的一级水（超纯水）。纯水的制备也可以采用多种纯化技术，例如反渗透、离子交换、连续电去离子技术、蒸馏。许多国际标准组织（ASTM,NCCLS,CAP,USP）所颁布的纯水水质标准和指南将帮助我们确定适当的水质。
纯水控制系统对于整个系统的操作、维护以及运行非常重要。因此纯水制备系统的显示面板所显示的信息应该简单明了，同时控制面板的操作也应该简易快捷。同时为了保证纯水制备系统的正常运行和产水水质，不仅要监控产水水质，同时也应该对进水水质进行监控（自来水水质）。最后还应考虑整个纯水制备系统所占用的空间以及系统运行成本。
不管是针对一个或者多个实验室的整体纯水系统，盐雾腐蚀试验箱还是整幢实验大楼的纯水系统，实验室设计人员和研究人员都应在纯水系统设计之处考虑一系列因素。纯水系统的设计、安装、试车、正常运行每一步都需要使用纯水的研究人员、建筑师、咨询师、承包商、设备处、仪器生产商之间的精诚合作。