血液采取后应尽快进行处理，使血清（浆）从与血细胞接触的全血中分离出来。其中血清与血浆的区别是血清是血液凝固后缺少纤维蛋白原的血浆，故血浆中除额外含有纤维蛋白原和抗凝剂外，其他成份均等同于血清。
对于选择测血清还是血浆样本，elisa试剂盒主要根据为由于血清中缺乏很多的凝血因子，但有一些凝血产物，如果是测凝血因子建议选择血浆样本；同时血浆中有纤维蛋白原，如果纤维蛋白原对待检测指标有影响，建议选择血清样本。大多数情况下二者均可以选择。
处理方法：
血清：将收集于血清分离管的全血标本在室温放置2 小时或 4 度过夜，然后 1000×g 离心 20分钟，取上清即可检测。标本放于-20度或-80保存，避免反复冻融。
血浆：可用EDTA或肝素作为抗凝剂，标本采集后30 分钟内于2 ~8度 1000 g 离心15 分钟，取上清即可检测。标本放于-20度或-80保存，避免反复冻融。一般建议用 2.0% EDTA，1%肝素，3.8%枸橼酸钠作为抗凝剂采集标本
处理样本的过程就是收集目标蛋白的过程，由于蛋白容易变性，降解，故该过程应尽量温和。样本处理之后的储存也非常重要，尤其注意不要反复冻融，样本处理之后可分装密封保存， 4 度保存应小于 1 周，-20 度不应超过 1 个月，-80度不应超过2个月。elisa试剂盒在标本使用前应缓慢均衡至室温，不应加热使之融解。