真菌产生有毒的代谢产物，可引起急慢性真菌中毒症，引起消化道中毒症状，而且可进入人体内引起病变，如引起肝脏损伤的黄曲霉毒素、杂色曲霉毒素；引起肾脏损害的桔青霉素；引起中枢神经系统损害的黄绿青霉素等。 甚至有的毒素具有致癌性，如黄曲霉毒素与肝癌发生有关。
检测真菌毒素有许多方法，如检测黄曲霉毒素有生物学方法和ELISA法等。  生物学方法主要用于检测真菌毒素的毒性，如用鸡胚、小白鼠作毒性试验，观察动物中毒死亡或出现肿瘤。
 ELISA法操作简便，并具有安全快速高效、费用低，适用于大批量标本的筛选。