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What?“垃圾DNA”
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为什么在您的科研中使用“假基因”的三个理由:
蛋白质编码DNA或“功能”基因在人类基因组中仅占2%。 至今,其余98%因共非编码特征而被称为“垃圾DNA”。 这个名字本身就意味着垃圾DNA是无用的,可以忽略。 然而,进一步的研究表明,实际上垃圾DNA可能对我们的基因组的功能至关重要。 例如,有没有想过为什么人星形胶质细胞和肝细胞来源于同一受精卵,并且携带完全相同的遗传信息,但它们的发育,形态和功能差别很大? 虽然部分原因在于表观遗传学,其中基因表达受表观遗传修饰如DNA甲基化调控,但一些研究人员也在寻找所谓的“垃圾DNA”中的线索。 结果发现了“假基因”,并揭示了它们维持正常细胞生物学的多种作用。
显然,“假基因”是与其相应的功能基因具有高序列相似性的DNA片段,但已失去其部分或全部功能。与功能基因研究的相比,“假基因”研究还处于起步阶段。 不过,您有理由认真对待您的研究中的“假基因”。
1. “假基因”的出现比想象中更常见、更重要
现在我们普遍认为,在人类基因组中,“假基因”的数目至少与蛋白质编码的“功能基因”的数量相当。许多基因,甚至是您的感兴趣的基因,都有一个或多个相应的“假基因”。 虽然仍然被认为是垃圾DNA,但是很多“假基因”都得到转录,有些甚至被翻译。证据表明,一些“假基因”的转录水平是至关重要的,“假基因”的失调可能诱发各种疾病和病症的发病机制。
2. “假基因”可能影响功能基因的表达。
如您所知,基因转录水平在正常细胞代谢的许多方面起决定性作用,并通过复杂的网络进行严格调控。“假基因”也可以在这个调节中发挥作用。许多“假基因”由基因的重复事件产生,因此与相应的功能基因序列有高度相似性。因此,当“假基因”被转录时,它们与功能基因相似的mRNA可以作为竞争的内源性RNA(ceRNA)来调节相应功能基因的表达水平。
3. 不能将“假基因”的转录水平与其相应的功能基因区分开来,可能会造成研究数据的假象。
虽然序列高度相似,“假基因”和相应的功能基因在细胞生物学中显然起不同的作用,并通过不同的机制进行调控。 分别分析是获取正确结论的先决条件。 以其高度序列相似性,通过qPCR分开它们是不容易的。 必须仔细设计引物,以确保不仅PCR高效率,而且还可以确保“假基因”或功能基因的特异性。许多时候,两者之间的差异只是几个核苷酸,需要专业知识才能成功进行qPCR分析。 区别较小的qPCR引物可能导致不可靠甚至错误的结论。
ScienCell研究实验室开发了世界上第一个假基因转录分析qPCR试剂盒,以更好地帮助您分析假基因转录及其对功能基因表达的影响。我们的试剂盒保证每个引物组仅扩增指定的基因或假基因而不进行交叉扩增。无论您是否已经考虑到假基因,或者只是在今天学习假基因,我们都向您伸出援助之手。我们的科学家将帮助确定与您的研究相关的假基因和评估它们的最jia方式。
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