全控制原则。对污水产生、处理、排放的全进行控制。减量化原则。严格内部卫生安全体系，在污水和污物发生源处进行严格控制和分离，内生活污水与病区污水分别收集，即源头控制、清污分流。严禁将的污水和污物随意弃置下水道。 就地处理原则。为防止污水输送中的污染与危害，在必须就地处理。 分类指导原则。根据性质、规模、污水排放去向和地区差异对污水处理进行分类指导。达标与风险控制相结合原则。考虑综合性和传染病污水达标排放的基本要求，同时加强风险控制意识，从工艺技术、工程建设和等方面应对突发件的能力。生态安全原则。有效去除污水中有毒有害，处理中副产物产生和控制中过高余氯，保护生态安全。

现在执行的《污水综合排放》（GB18466-2005），将污水按其受纳水体不同的使用功能等规定了相应的粪大肠杆菌群数和余氯，对COD、SS等理化指标无特别要求，只需达到要求相对较低的其他排污单位，且只给出余氯下限而无上限。

根据现行，现有污水处理工艺别低，主要存在(1) 悬浮物浓度高，影响效果；(2)水质波动大，剂投加量难以控制；(3) 副产物产生量大，影响生态的安全；(4）余氯无上限，过多余氯危害生态安全等问题。