圆筒形联轴器会产生径向力，因此在设计、加工、组装时请充分注意内外磁转子之间的位置。该径向力不仅会影响力矩的传递，还会直接影响轴承的寿命，严重时磁耦合器将停止工作。解决该径向力的关键是确保内外磁转子所需的同轴度。另外，组装和拆卸磁力泵时，需要用的工装和工具，以免人和零件相撞受伤。

磁力泵工作期间，隔板处于交变磁场中，会感应涡电流。这个涡流，一方面消耗了轴力，降低了传动效率。另一方面，转化为热量传递到介质，提高循环介质的温度。因此，隔板设计必须注意材料的选择和几何形状尺寸，特别是容易气化的液体的输送。研究表明，降低涡流损耗的主要方法是选择高电阻率、高强度的材料，尽量减小隔板直径。