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组织从-80冰箱拿出来之后放到了-20,过了6天才放回-80,对后续提取RNA跑QPcr影响大吗?

提供者:上海笃玛生物科技有限公司   发布时间:2026/10/10 13:40:56  阅读次数:72次  进入该公司店铺

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组织从-80冰箱拿出来之后放到了-20,过了6天才放回-80,对后续提取RNA跑QPcr影响大吗?



情况总结

组织从‑80 拿出来放到‑20,连续 6 天,全程没有融化(维持固态冰冻),之后放回‑80。

关键点:不是拿出来室温化冻,只是保存温度从‑80 升高到‑20,组织依旧是冻硬的冰块,没有变成液态。

1、风险有多大

✅如果全程组织始终坚硬冰冻,没有发生解冻回融:多数普通动物组织 RNA 不一定会明显降解,还可以继续做 qPCR,但可靠性相比一直‑80 保存有所下降,属于有风险的样本,不是完全报废。

⚠️如果冰箱‑20 实际温度波动、组织边角发生局部微解冻(肉眼不一定看得出来),细胞内 RNase 会释放,RNA 发生降解;长片段 mRNA 优先受损;短片段的靶基因相对耐受更好PMC。

⚠️大块组织风险高于分装后的小块组织;脾脏、胸腺这类 RNase 含量高的组织降解风险明显高于肌肉、脂肪。脑组织介于中间。

⚠️不建议直接拿去正式实验,必须先质控 RNA 再决定是否能用。

2、接下来该怎么做

提取 RNA 之后一定要测完整性:
优先用毛细管电泳看RIN 值;琼脂糖电泳看 28S/18S 条带;Nanodrop 仅看 A260/A280不能判断降解。

RIN≥7:一般还可以用于 qPCR;

RIN 6‑7:只能优先选扩增子短(70‑150 bp)的引物;长扩增子不建议;

RIN<6:不建议用于基因表达 qPCR,结果 Ct 会漂移,组间比较不可靠PMC。

ELISA39.jpg

实验设计上的补救

这批样本全部标记 “曾经‑20 放置 6 天”;同一批实验里不要混一批一直‑80 保存的对照组样本直接做差异比较;尽量所有实验组样本都经历同样的储存偏移;如果对照组一直‑80,不要和这批样本放在一起比较,会引入储存带来的系统偏差。

内参基因也要留意,部分内参在 RNA 轻微降解时 Ct 同样会上移。

论文材料方法部分要如实记录这个储存意外。

3、以后注意

冻存组织理想长期保存是‑80;‑20 并不适合长期保存组织块(适合纯化好的 RNA 短期放);以后尽量不要把组织块长期放在‑20。
已经放回‑80 的这批样本不要再反复拿出来挪动,尽快完成 RNA 提取。

简短结论

不一定直接废掉,但存在 RNA 降解风险;一定要做 RIN 质控;质控合格后优先用短扩增子 qPCR;注意不要直接跟始终‑80 的样本做组间对比。



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