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龈沟液样本提取注意事项

提供者:深圳瑞清生物信息科技有限公司   发布时间:2026/5/19 10:42:21  阅读次数:712次  进入该公司店铺

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龈沟液(GCF)样本的提取(即从采集后的滤纸条/毛细管中将目标蛋白、核酸、代谢物释放到溶液中的过程)是决定下游检测(如ELISA、质谱、PCR、测序)成败的关键环节。
由于龈沟液总量极微(每个位点仅0.05-0.5 μL),且滤纸纤维对生物大分子有较强吸附,提取过程极易发生样本损耗或降解。以下是龈沟液样品提取的核心注意事项:
一、 提取前的准备与样本处理
全程低温操作(防降解)
从 -80℃ 冰箱取出样本后,必须始终置于冰上操作。
提取用的离心机需预冷至 4℃,超声破碎仪的水槽也需加冰水混合物,防止提取过程中局部升温导致蛋白变性或RNA降解。
添加抑制剂(保真度)
提取蛋白质:洗脱液中必须添加蛋白酶抑制剂 Cocktail(如PMSF、EDTA等),因为龈沟液中富含来源于宿主和细菌的蛋白酶,极易降解目标蛋白。
提取RNA:洗脱液需含强效去垢剂(如SDS)或直接使用裂解液(如TRIzol/Qiazol),并操作迅速,防止RNase降解RNA。
滤纸条的剪碎(增加接触面积)
操作:使用灭菌的眼科剪或手术刀片,在冰浴上的无菌平皿或离心管内,将带有龈沟液的滤纸条(如Periopaper)剪成 1-2 mm 的碎块。
注意:剪刀必须用酒精灯灼烧或高压灭菌,每处理一个样本必须更换或重新消毒剪刀,严防交叉污染。剪碎能极大地破坏滤纸纤维网,释放被包裹的液体。
二、 洗脱/裂解过程的核心技巧
洗脱液体积的权衡
体积太小:洗脱不充分,回收率低;
体积太大:目标物被过度稀释,超出下游检测的灵敏度。
建议:单根滤纸条通常加入 100-200 μL 洗脱/裂解缓冲液。如果下游检测灵敏度低(如某些ELISA),可考虑将同一受试者的多个位点滤纸条合并提取,或使用真空浓缩仪浓缩提取液。
强化洗脱手段(破除物理吸附)
剧烈震荡:加入洗脱液后,在振荡器(Vortex)上最高速剧烈震荡 1-2 分钟,使液体与滤纸碎屑充分混合。
反复冻融(最有效):将震荡后的样本放入 -80℃ 快速冷冻,取出后迅速在 37℃ 或室温融化,如此循环 2-3次。冰晶的膨胀和融化能有效破坏滤纸纤维和细胞,释放内含物。
超声辅助:冰浴下进行超声破碎(建议低功率、短时间、多次脉冲,如30秒总时间,开2秒停3秒),进一步打断纤维和细菌细胞壁。
孵育时间
剧烈震荡和冻融后,通常需要在 4℃ 摇床上缓慢孵育 30-60 分钟,让洗脱液充分渗透并置换出吸附在纸上的分子。
三、 离心与收集(减少损耗)
高速离心
洗脱孵育结束后,在 4℃ 下进行高速离心(12,000 - 14,000 rpm,15-20 分钟)。
高速离心的目的是将滤纸碎屑、细胞碎片、不溶物彻di沉淀。
小心吸取上清液
移液枪吸取上清液时,枪头切勿触碰底部的滤纸碎屑沉淀,否则容易将杂质重新悬起。
尽量吸净上清液,但如果液面太浅,宁可留少许液体在底部,也不要吸到沉淀,因为沉淀中含有大量干扰下游检测的杂质(如纤维素、脂质)。
二次离心(可选但推荐)
将shou次收集的上清液转移到新的离心管中,再次 14,000 rpm 离心 10 分钟,以去除可能悬浮的极微小纸屑,确保提取液绝对澄清。
四、 提取后的处理与保存
分装(防反复冻融)
提取后的液体严禁全管反复冻融。应根据下游实验的用量(如ELISA用50μL,PCR用20μL),将提取液分装入多支薄壁PCR管或进口低吸附离心管中。
浓缩(针对极度稀释的样本)
若洗脱液体积过大导致目标物浓度低于检测下限,可使用真空离心浓缩仪(SpeedVac)在低温下浓缩至所需体积。注意不要完全抽干,否则蛋白难以复溶。
长期保存
短期(1-2天内检测)可放 4℃;长期保存必须放 -80℃。
五、 针对不同提取靶标的特殊注意
jQuery3600813516131196341_1779158525850 核心避坑总结:
滤纸条不是普通的容器,它是“分子陷阱”。 简单的浸泡只能洗出不到50%的龈沟液。“剪碎 + 冻融 + 超声 + 离心” 四步法是打破这个陷阱、实现高回收率的黄金法则。

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