二、阳性率：
阳性细胞数/总细胞数：分析阳性细胞数占总细胞数的占比。反映阳性细胞数量比率高低，成正比。优点适用于细胞类型较单一的情况。比如肿瘤组织中KI67指标肿瘤细胞增值比率，脾脏组织内CD3指标T细胞比率等。

三、阳性细胞密度：
阳性细胞数/待测区域组织面积：分析阳性细胞数占待测区域组织面积之比。反映单位面积内阳性细胞个数，成正比。优点不受多种细胞类型数量影响。常用在浸润型的炎性细胞中，比如肝组织中某类炎性细胞占比，代表性指标MPO、CD68等。

四、阳性强度:
各阳性点颜色深浅的平均值：反应整张片子或者某个区域阳性的平均深浅度。明场为平均光密度（average optical density），暗场为平均强度（average intensity），数值越阳性程度越强。适用性广，由于没有考虑阳性面积，在端情况下会出现，阳性少且颜色深时阳性强度值高，阳性点多且颜色浅时阳性强度值低。可以结合阳性面积一起评价。

五、阳性面积比：
阳性面积/待测区域组织面积：不考虑阳性深浅的变化，单纯的比较阳性面积占比。

六、MVD，微血管数量/视野：
单位面积内微血管数量，对于微血管的识别不需具备完整的管腔和红细胞，只要有明显的血管内皮细胞染色、并且能与相邻的血管、实质细胞以及间质成分相分隔的，就可视为一个独立的血管，分辨不清、管腔直径＞8个红细胞直径的血管以及具有较厚肌层的血管不纳入计数内。常用指标CD31、CD34。此项只能分析高倍视野的图片。

七、IRS评分：
对免疫组化切片中的染色程度（0-3分）以及阳性率（0-4分）分别评分后相乘得到综合评分（0-12分）。具体如下，染色强度以目的细胞呈现染色特性计分：无着色为0分，淡黄色为1分，棕黄色为2分，棕褐色为3分；以细胞阳性比率进行计分：0～5%为0分，6%～25%为1分，26%～50%为2分，51%～75%为3分，>75%为4分。综合评分可划分阳性高低后进行统计，常用于癌和癌旁的芯片生存分析中。

八、H-Score：
即 Histochemistry score （组织化学评分）的缩写，是处理免疫组化的一种组织学评分方法，将每张切片内阳性数量及其染色强度转化为相应的数值，达到对组织染色半定量的目的。H-Score（H-SCORE=∑（pi×i）=（percentage of weak intensity×1)+(percentage of moderate intensity×2)+(percentage of strong intensity×3)，式中pi表示阳性信号像素面积/细胞数量占比；i代表着色强度）。H-score为0-300之间的数据，数据越说明综合阳性强度越强。