提供者:MedChemExpress 发布时间:2024/12/27 13:07:17 阅读次数:2769次 进入该公司店铺
小 M, 小 M, 我导儿开始安排测 IC50 了,虽然查文献经常遇到……但还是晕,概念分不清?不懂如何测?有啥区别?确实!大家常在文献中看到 IC50、EC50、ED50 等数值的测定,实验不迷茫~我们先从大家最熟悉的 IC50 值开始。
IC50(Half maximal inhibitory concentration) 又叫半数抑制浓度,So,单位是浓度单位,比如 nM、µM 等等。
我们常在文献中看到 IC50、EC50、ED50 等等数值的测定,这些指标被广泛应用于药物开发、毒理学、基础研究等领域,为理解药物效应和优化治疗策略提供了有力支持。
IC50 值的应用: 初步筛选:在药物发现过程中,IC50 值用于筛选潜在的药物候选分子,以确定其对特定靶标如酶抑制的活性。 优化化合物:通过比较不同化合物的 IC50 值,研究人员可以优化药物分子的结构,提高其效能。 细胞生物学研究:IC50 用于评估化合物对癌细胞或其他细胞类型的毒性,帮助研究其对细胞生长和存活的影响。 毒理学研究:在药物安全性评估中,IC50 值用于确定化合物对正常细胞的影响,评估其潜在的副作用。 一、激酶抑制剂的 IC50 值,如何测?
(2) IC50 值测定:对初筛所得 33 个分子化合物复筛 ,将其按实验设计加入激酶反应体系中,进行 IC50 值测定。
(3) 发光测定:通过发光测定监测 CaMKII-δ 磷酸转移酶活性(注意:如果激酶反应不是在室温下进行,在加入 ADP-Glo™ 试剂之前,将板平衡至室温)。
(4)记录发光:使用微孔板读数仪记录读数。
(5) 数据分析:数据以平均值 ±SEM 表示。使用 GraphPad Prism 版本 8.01 (GraphPad Software, Inc.) 和 SPSS 24.0 软件包 (IBM SPSS Statistics,版本 24.0) 进行统计分析。
当 CaMKII-δ 被激活时,它会通过将 ATP 转化为 ADP 来磷酸化底物。在该测定中,CaMKII-δ 的肽底物 (Autocamtide-3) 的磷酸化与 ATP 到 ADP 的转变酶促偶联。ADP-Glo 试剂用于终止激酶反应并去除未反应的 ATP。加入激酶检测试剂终止 ATP 消耗反应并将 ADP 转化为 ATP,然后通过荧光素酶反应将 ATP 进一步转化为光。
二、细胞毒活性试验的 IC50 值,如何测?
图 3. 吡啶和噻唑衍生物对肺癌 (A549) 细胞系的抑制作用[2]。
(1) 化合物制备:将合成的化合物及参考药物阿霉素溶解于 DMSO 中。准备不同浓度的工作溶液以供实验使用。
(2) 细胞处理:将预培养的细胞系暴露于不同浓度的测试材料,在 37°C 下孵育 24 小时。使用 PBS 清洗去除死细胞。
(3) MTT 染色:向每个孔加入 25 µL 0.5% MTT 染液。在 37°C 条件下孵育 3-4 小时。
(4) 溶解与读数:加入 0.05 mL DMSO 溶解细胞内形成的甲瓒晶体,并在摇床上放置 30 min。利用 ELISA 板读数仪测量各孔的吸光度值。
▐ IC50 值的数据处理
实验设计:进行细胞或酶实验,将靶标 (如细胞系、酶等) 暴露于多个不同浓度的药物中。
处理数据:将所得表格数据进行转化,使用 Graphpad prism 软件计算—创建表格—输入浓度和抑制率—点击 Analyze,选择对数变换--通过非线性回归 (Non-linear regression) 对实验数据进行拟合---得 IC50 值,其标准曲线为 S 型曲线。
图 4. IC50 值的标准曲线。
需要注意的是!虽然 IC50 的应用十分广泛,但 IC50 值是通过体外实验获得的,仅为体外数据,不能完全反映药物在体内复杂环境下的效果。
产品推荐 MTT 是一种黄色的水溶性四唑盐,活细胞线粒体中的脱氢酶可以将 MTT 还原成不溶性的紫色结晶甲瓒,通过测量甲瓒的颜色变化来反映细胞活力。 Cell Counting Kit-8 (HY-K0301) WST-8 在电子载体 1-Methoxy PMS 的作用下,可以被细胞内脱氢酶还原成水溶性的橙黄色甲臜 (formazan)。 WST-1 诱导细胞内线粒体脱氢酶进行 NADH 依赖的酶切反应,释放出水溶性的甲臜产物,通过测定 450 nm 处的吸光值来反映细胞活力。 参考文献: [1] Zhang J, et al. Novel CaMKII-δ Inhibitor Hesperadin Exerts Dual Functions to Ameliorate Cardiac Ischemia/Reperfusion Injury and Inhibit Tumor Growth. Circulation. 2022 Apr 12;145(15):1154-1168. [2] Ashmawy FO, et al. Synthesis, In Vitro Evaluation and Molecular Docking Studies of Novel Thiophenyl Thiazolyl-Pyridine Hybrids as Potential Anticancer Agents. Molecules. 2023 May 23;28(11):4270. [3] Gui, H., et al. Effects of Boletus Poisoning on Estrogen Receptors and Neurotransmitters in Rats Based on ERk1/2 Pathway. Neural Process Lett 55, 193–203 (2023). [4] Abal P, et al. Acute Oral Toxicity of Tetrodotoxin in Mice: Determination of Lethal Dose 50 (LD50) and No Observed Adverse Effect Level (NOAEL). Toxins (Basel). 2017 Feb 24;9(3):75.
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