通用型气相色谱仪在水质监测化学污染物的检测领域中，主要用于有机氯农药、有机磷农药、有机化学污染物及微量金属元素的监测。气相色谱仪在有机氯农药的检测中的应用。有机磷农药多为磷酸酯类或硫代磷酸酯类，有机磷农药多为油状液体，工业品呈淡黄至棕色，具有大蒜臭味。一般不溶于水，而溶于有机溶剂及动植物油，对光、热、氧均较稳定，遇碱易分解破坏。有机磷农药可经消化道、呼吸道及完整的皮肤和粘膜进入人体。人体吸收的有机磷农药在体内分布于各器官，其中以肝脏含量zui大。
通用型气相色谱仪效液相色谱法与气相色谱法相比，显著优点是样品的适用范围宽。气相色谱法虽然也具有快速、分离效率高、样品用量少等优点，但分析的样品必须能够气化。在所有的化合物中可以直接用气相色谱法分析的物质只占约20%。而液相法只要求样品能制成溶液而不需要气化，因此不受样品挥发性和热稳定性限制。通用型气相色谱仪能用液相进行分析的物质占有机物总量的75-80%。因液相具有适用范围广、分率高、速度快、灵敏度高、流动相可选择范围宽、色谱柱可反复应用、流出组分容易收集、安全及操作自动化程度高等特点而较广泛应用于各种分析领域，也是环境和卫生检测常用的极其重要的分析手段。
通用型气相色谱仪在微量金属元素的检测中的应用，气相色谱法不仅是分析检测有机污染物*的重要方法，近年来，在分析水体中某些微量金属元素方面也取得了一定的发展。液相色谱柱按几何特性可分为常规柱、快速柱和微量色谱柱，后者又分为细管径柱、填充毛细管柱和开管柱。近年来，快速柱和微量色谱柱的开发已逐渐引起人们重视。由于柱填充技术的完善和3μm填料的出现，快速柱仅用3-5cm的柱长，就能获得4000-5000个理论塔板数，能显著地缩短分析时间和节省大量溶剂。细管径色谱柱由于分辨率高、检测灵敏度高、溶剂消耗少及便于联用技术的实现，具有美好的应用前景。
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