不同的光源发射出特定的发射光透过载物的微孔板、光的一部分被物质吸收，从而前后光的强度发生变化，这种特异性的强度变化与被测物浓度呈一定比例关系，能够定量、定性地检测结果。该仪器操作简单，技术成熟，但灵敏度不高，当需要测定不同波段时，需切换不同光源。

顾名思义，此酶标仪用来检测荧光，特定的激发光照射在被测荧光物质上，继而被测物进入激发状态，释放出发射光，由检测器记录发光强度，推导荧光物质的量。优点在于灵敏度高，但由于发射光和激发光强度可能会叠加或减弱，造成测定误差。

是通过某些生物或化学反应发光，通常会用到荧光素酶，加好试剂和样品的多孔板放置到酶标仪中，会对其产生的光信号进行检测，进行定量检测，灵敏度高于以上两种酶标仪，动态范围广。