傅立叶变换红外光谱仪的原理是通过测量经过红外吸收的干涉图，并对其进行傅立叶积分变换来获得被测物质的红外波段的光谱图，从而可以对该物质的元素，组分和分子结构进行分析和确定。和传统的色散型光谱仪相比，傅立叶变换红外光谱仪可以获得较好的信噪比和分辨率。目前学校和研究所里使用的红外谱仪很多都是傅立叶变换红外谱仪(FTIR).
优点如下：
1）扫描速度快。傅立叶变换红外光谱仪的扫描速度比色散型仪器快数百倍，而且在任何测量时间内都能获得辐射源的所有频率的全部信息,即所谓的“多路传输”。对于稳定的样品，在一次测量中一般采用多次扫描、累加求平均法得干涉图,这就改善了信噪比。在相同的总测量时间和相同的分辨率条件下，傅里叶变换红外光谱法的信噪比比色散型的要提高很多。
2）波数精度高。波数是红外定性分析的关键参数，因此仪器的波数精度**重要。因为干涉仪的动镜可以很准确地驱动，所以干涉图的变化很准确，同时动镜的移动距离是****激光器的干涉纹测量的，从而保证了所测的光程差准确，因此在计算的光谱中有很高的波数精度和准确度，通常可到 0.01cm-1。
3）具有很高的分辨率。分辨率是红外光谱仪的主要性能指标之一，指光谱仪对两个靠得很近的谱线的辨别能力。傅里叶变换红外光谱仪均有多档分辨率值供用户据实际需要随选随用。 
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