液相色谱非常适合分子量较大，难气化;不易挥发或对热敏感的物质，离子型化合物及高聚物的分离分析，大约占有机物的70～80%气相色谱的流动相载气是色谱惰性的永久性气体，不参与分配平衡过程,与样品分子无亲和作用，样品分子只与固定相相互作用。而在液相色谱中流动相是各种低沸点有机溶剂及水溶液。也参与样品分子相互作用，因此液相色谱流动相的作用比气相色谱大，气相色谱的载气仅数种，其性质差别也不大，对分离效果影响也不大。而液相色谱的流动相种类多，性质差别也大，对分离效果影响显著。因对于LC来说，流动相的选择很重要，为提高选择性增加了一个因素。液相色谱也可选用不同比例的两种或两种以上的液体作流动相,增大分离的选择性。

液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液相色谱可分为液-固吸附色谱;液-液分配色谱;离子交换色谱和凝胶渗透色谱等多种类型。液—固色谱的色谱柱内填充固体吸附剂，由于不同组分具有不同的吸附能力。因此，流动相带着被测组分经过色谱柱时，各组分被分开液—液色谱的流动相和固定相都是液体。作为固定相的液体涂在惰性担体上，流动相与固定液不互溶，当带有被测组分的流动相进入色谱柱时，组分在两相间很快达分配平衡，由于各组分在两相间分配系数不同而彼此分离。以非极性溶液作流动相,极性物质作固定相的液—液色谱叫正相色谱;极性溶液作流动相，非极性物质作固定相的液—液色谱叫反相色谱。离子交换色谱的色谱柱内填充离子交换树脂，依靠样品离子交换能力的差别实现分离。而凝胶色谱是按试样中分子大小的不同来进行分离的。在上述四类色谱中，应用最广泛的是液—液色谱。液相色谱作为分析时选择余地大，而气相色谱达不到。