培养基通常采用高压湿热灭菌法121 ℃灭菌15分钟，特殊培养基按使用者的特殊要求进行灭菌（如含糖培养基115 ℃灭菌20分钟）。

部分培养基（如嗜盐琼脂培养基、胆硫乳培养基），只能煮沸灭菌。

对热敏感的培养基或添加物质，应采用膜过滤方法进行过滤除菌。

即用型试剂不需灭菌，应参见相关国际标准或供应商使用说明，直接使用。

器具和设备消毒处理方法

湿热灭菌：采用高压灭菌器， 121 ℃灭菌20分钟，适用于玻璃器皿、移液器吸头、塑料瓶等。按照GB 15981 的规定，评价高压灭菌器的杀菌效果。

干热灭菌：采用干燥箱灭菌，160 ℃灭菌2h，180 ℃灭菌2h，适用于玻璃器皿，不锈钢器具等。

液体消毒剂消毒：使用适当浓度的自配或商业液体消毒剂（参见表1）对工作台面、器具或设备表面进行消毒。可按照GB15981 的规定，评价自配或商业消毒剂的消毒效：可按照ISO 18593检测工作台面、器具或设备表面的消毒效果。