利用磁性物质同性相斥的特性，通过不断变换基座的两端的极性来推动磁性搅拌子转动，通过磁性搅拌子的转动带动样本旋转，使样本均匀混合；

通过底部温度控制板对样本加热，配合磁性搅拌子的旋转使样本均匀受热，达到指定的温度；

通过加热功率调节，使升温速度可控，以适用更广阔的样本处理过程。

一般的磁力搅拌器具有搅拌和加热两个作用。

具体为：

第一个作用，使反应物混合均匀，使温度均匀；

第二个作用，在一个密闭的容器中加热，需要防止暴沸，例如在蒸馏过程中，可以加入沸石，也可以用磁力搅拌器；

第三个作用，加快反应速度，或者蒸发速度，缩短时间。