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ac4C乙酰化RNA免疫沉淀测序（acRIP-seq）
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更新日期：2024/7/31 11:43:30
生 产 地：中国大陆
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详细内容
ac4C RNA乙酰化（N4-acetyicytidine，ac4C），N4位乙酰胞嘧啶，是真核原核生物中保守的化学修饰，早期研究认为ac4C主要存在于tRNA和18SrRNA上。近期研究显示，mRNA上也存在大量的ac4C，该修饰在促进蛋白翻译、影响RNA稳定性和可变剪接、调控基因表达发挥重要作用，是继m6A修饰之后表观转录组学的新兴发展方向。
ac4C RNA修饰的检测，易基因采用基于抗体富集的ac4C RNA乙酰化免疫共沉淀 (acetylated RNA Immunoprecipitation acRIP)技术：基于抗体特异性结合乙酰化修饰碱基原理，以RNA免疫共沉淀富集乙酰化修饰片段为基础，然后通过高通量测序（acRIP-seq），在转录组范围内研究发生乙酰化的RNA区域，高效获得结果。
易基因提供适用于不同科研需求的acRIP -seq技术：
ac4C 乙酰化-常量：mRNA acRIP -seq
ac4C 乙酰化-常量：mRNA +lncRNA acRIP -seq
ac4C 乙酰化-微量：mRNA +lncRNA acRIP -seq
实验策略：
分析内容：
送样要求：
典型案例：
mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化可提高翻译效率 Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
期刊：Cell IF：45.5
N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）是一种由乙酰转移酶NAT10催化的mRNA修饰。本研究通过对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA-seq，揭示了ac4C在编码序列中的特异性乙酰化区域富集。NAT10敲除导致在比对mRNA位点的ac4C检测减少，并与靶向mRNA整体下调相关。对mRNA半衰期分析显示，乙酰化mRNA稳定性依赖于NAT10。进一步实验表明，mRNA乙酰化在体内外增强底物翻译。在ac4C peaks的密码子含量分析揭示了在动态位点中胞嘧啶的偏倚表达，从而影响mRNA解码效率。这些发现扩展了mRNA修饰范围（包括乙酰化残基），并阐明了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。
acRIP-seq绘制mRNA ac4C图谱
参考文献：
Arango D, et al. Immunoprecipitation and Sequencing of Acetylated RNA. Bio Protoc. 2019 Jun 20;9(12):e3278. pii: e3278. doi: 10.21769/BioProtoc.3278. PubMed PMID: 33654795. Arango D, et al. Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency. Cell. 2018 Dec 13;175(7):1872-1886.e24. pii: S0092-8674(18)31383⁻⁷. doi: 10.1016/j.cell.2018.10.030. PubMed PMID: 30449621.
