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细菌RNA提取试剂盒
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详细内容
细菌RNA提取试剂盒
B a c t e r i a R N A P u r i f i c a t i o n K i t
( 离 心 柱 型 )
产品及特点:
本试剂盒在无苯酚、 RNA 快速提取技术基础上,通过基因组 DNA 清除柱技术
确保有效清除 gDNA 残留,得到的 RNA 不需要 DNase 消化,可直接用于反转录 PCR、
荧光定量 PCR 等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞 RNA 酶,然后裂解混合
物通过一个基因组 DNA 清除柱,基因组 DNA 被清除而 RNA 穿透滤过。滤过的 RNA 用
乙醇调节结合条件后,RNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一
系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,
低盐的 RNase free H2O 将纯净 RNA 从硅基质膜上洗脱。
它具有下列特点:
1.安全,完全不使用有毒的苯酚,等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2.快速,简捷,单个样品操作一般可在 30 分钟内完成。
3.稳定:多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280 典型的比值达 1.9-2.0,基本无 DNA
残留,可用于 RT-PCR,Northern-blot 和各种实验。
适用范围:
适用于快速提取细菌总 RNA,可有效清除 gDNA 残留,不需要使用 DNase 消化,RNA
可直接用于反转录 PCR,荧光定量 PCR.。
产品货号:XY9120103
产品规格:50T/1249元
成分规格:
运输及保存
室温储存 12 个月不影响使用效果。溶菌酶储存于 4℃。
储存事项:
1. 所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在
37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。
2. 不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室
温下(15℃-25℃)进行。
3. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH 值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
使用方法
自备试剂
无水乙醇。
提示(实验前请先阅读注意事项)
次使用前请先在 Buffer RW 瓶和 70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇! 充分混匀,加入后请
及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!)
提取细菌 RNA 需先配制加了溶菌酶的 TE (10 mM Tris-HCl,1mM EDTA pH8.0),TE 中溶菌酶
的终浓度为 1mg/ml
1. 离心收集 1-2ml 菌液(约108-109细胞)到一个 1.5ml 离心管,尽可能去除上清,注意残
留的上清不能超过 20µl/每使用 100µl TE(见步骤 2)。
2. 根据细胞的种类和数量,充分重悬细胞在 100µl(<5x108细胞)/200µl(5x108⁻⁷.5x108细
胞)TE 中(TE 中需先加入溶菌酶,终浓度浓度为 1mg/ml)或者直接用 TE 重悬后,用干
净吸头挑取少许溶菌酶加入。
3. 室温(15-25℃)温育 5 分钟/溶菌酶,破解细胞壁。每 2 分钟涡旋振荡 10 秒帮助破壁。
(注意:各种细菌破壁的难易程度不一样,一般革兰氏阴性菌 E.coli 使用上面的条件就足够了,甚至可
能省略该步骤,但是某些革兰氏阳性菌如 B. subtilis 难破壁需要提高溶菌酶浓度到 15mg/ml 和温育时
间到 10 分钟。如果金黄色葡萄球菌需要加入 lysostaphin 到 1mg/ml,37℃温育 15 分钟。总之不同细
菌类型破壁难易程度不同,有的难破壁的种类需要根据用户自己的具体情况调节酶的种类、工作浓度
和温育温度、时间,此外还可以联合使用玻璃珠击打,机械破壁,蛋白酶 K 消化等方法帮助破壁。)
4. 短暂离心收集细胞到管底,吸弃上清。涡旋振荡重悬分散细胞。
5. 加入 500µl Buffer RLT Plus,吹打混匀后用手剧烈振荡 20 秒,充分裂解。
(注意:一般加入裂解液后充分涡旋吹打后应该见不到明显团块或者不溶物,极少数情况下如果有明
显团块或者不溶物可以将裂解物 13,000rpm 离心 3 分钟,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物,将裂解物
上清全部转到一个新的离心管再进行下一步。)
6. 立刻将裂解物加入一个 DNA 清除柱上(清除柱放在收集管内)13,000 rpm 离心 30
秒,保留滤过液(RNA 在滤过液中)。
(注意:确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。)
7. 用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为 500µl,滤过时候损失体积应该减去), 加入等体积的 70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!),此时可能出现沉淀,但是不影
响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
8. 立刻将混合物(每次小于 700µl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱 RA 中,(吸附柱放
入收集管中)13,000 rpm 离心 30 秒,弃掉废液。
9. 加 700µl Buffer RW1,室温放置 30 秒,13, 000rpm 离心 30 秒,弃掉废液。
10.加入 500µl Buffer RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000 rpm 离心 30 秒,
弃掉废液。加入 500µl Buffer RW,重复一遍。
11.将吸附柱 RA 放回空收集管中,13,000 rpm 离心 2 分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液
中残留乙醇抑制下游反应。
12.取出吸附柱 RA,放入一个 RNase free 离心管中,根据预期 RNA 产量在吸附膜的中间
部位加 30-50µl RNase freeH2O,室温放置 1 分钟,13,000 rpm 离心 1 分钟。
(注意:洗脱体积应不少于 30µl ,体积过小影响回收效率。如果需要得到更大浓度的 RNA,将离心
得到的 RNA 溶液加回到吸附住重复洗脱一遍。)
注意事项
●所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到 13,000 rpm 的传统台式离心机,
●样品处理量绝对不要超过基因组吸附柱 DA 和和 RNA 吸附柱 RA 处理能力,否则造成 DNA 残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品 DNA/RNA 含量时宁可使用较少的 样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。
●Buffer RLT Plus 和 Buffer RW1 中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套,避免沾染皮肤, 眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
●关于 DNA 的微量残留:
一般说来任何总 RNA 提取试剂在提取过程中无法完全避免 DNA 的微量残留(DNase 消化也无
法做到 100%无残留),本试剂盒可以做到绝大多数 DNA 已经被清除,不需要 DNase 消化,可直
接用于反转录 PCR 和荧光定量 PCR。个别特殊情况如 DNA 含量过于丰富造成残留或者要进行
严格的 mRNA 表达量分析荧光定量 PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:
1) 选用跨内含子的引物,以穿过 mRNA 中的连接区,这样 DNA 就不能作为模板参与扩增反应。
2) 选择基因组 DNA 和 cDNA 上扩增的产物大小不一样的引物对。
3) 将 RNA 提取物用 RNase-free 的 DNase I 处理。本试剂盒还可以用于 DNase I 处理后的 RNA
清洁(cleanup)。
4) 在步骤 Buffer RW1 漂洗前,直接在吸附柱 RA 上进行 DNase I 处理。
5) RNA 纯度及浓度检测:
完整性:RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度 1.2%;0.5×TBE 电泳缓冲液;150v,
15 分钟)检测完整性。由于细菌中 70%-80%的 RNA 为 rRNA,电泳后 UV 下应能看到非常明显的
rRNA 条带。细菌 rRNA 大小分别约为 5 kb 和 2kb,分别相当于 26S 和 13S rRNA。细菌 RNA 样
品中最大 rRNA 亮度应为次大 rRNA 亮度的 1.5-2.0 倍,否则表示 RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
纯度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的参考指标。高质量的 RNA,OD260/OD280 读
数在 2.1-2.2 之间(100%纯的 RNA 比值一般是 2.2 左右,很多公司无法达到这个标准,所以 1.9-2.0
就凑合用了,但是我们的产品标准一般可以达到 2.1-2.2)。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的
pH 值影响。同一个 RNA 样品,假定在 10mM Tris,pH7.5 溶液中测出的 OD260/OD280 读数 1.8-2.1
之间,在水溶液中所测读数则可能在 1.5-1.9 之间,但这并不表示 RNA 不纯。
浓度:取一定量的 RNA 提取物,用 RNase-free 水稀释 n 倍,用 RNase-free 水将分光光度计调零,
取稀释液进行 OD260,OD280 测定,按照以下公式进行 RNA 浓度的计算:终浓度(ng/µl)
=(OD260)×(稀释倍数 n)×40
仅用于科研,不能用于临床诊断!所有产品仅供科研使用,不得用于人或动物的治疗等任何其他用途,不为任何个人提供产品和服务。以实际收货产品说明书为准,网站说明书仅供参考。
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