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进行 RT-PCR 实验时,对样本有哪些要求?

发布时间:2026/10/20 14:07:24关注度:12

进行 RT-PCR 实验时,对样本有哪些要求?


样本最核心的要求是RNA 尽量完整、无明显降解,无 RNase 污染,杂质与基因组 DNA 干扰可控。

样本采集与离体处理方面,组织样本离体后要快速处理,尽量在几分钟内放入液氮速冻或者 RNA 保护液,室温放置时间越短越好,防止内源 RNase 降解 RNA。细胞样本吸弃培养基后,可直接加裂解液,或者离心收集细胞沉淀,快速冻存。体液样本收集后及时离心去除细胞碎片,分装保存,避免反复冻融。

样本保存条件,所有样本建议分装成单次实验用量,避免反复冻融。短期保存可放 4℃数小时;长期保存,组织、细胞沉淀放负 80℃。不要放在冰箱门位置,温度波动大容易降解。样本不能反复解冻冻融,每一次冻融都会加速 RNA 断裂。

RNA 质量要求,提取后的 RNA 需要检测纯度与完整性。A260/A280 比值在 1.8 至 2.1 区间较为合适,比值偏低提示蛋白或者酚类残留,偏高一般无明显影响。A260/A230 比值建议大于 2.0,比值过低代表多糖、酚类、盐离子等杂质残留,会抑制逆转录和 PCR 酶活性。同时评估 RNA 完整性,琼脂糖电泳或者毛细管电泳观察条带,完整总 RNA 会有清晰的核糖体 RNA 条带,条带弥散说明 RNA 严重降解,不适合 qPCR。

抑制物控制,样本中残留的血红蛋白、多糖、酚、乙醇、高浓度盐离子都会抑制逆转录酶与 Taq 酶。组织样本尤其是骨、植物样本,要重点去除这类杂质;血液样本避免严重溶血。若存在抑制物,会出现扩增效率下降、Ct 值异常偏大。

ELISA12.jpg

基因组 DNA 污染控制,样本尽量减少 gDNA 残留。提取 RNA 时可选用带 DNase 处理的方案。后续实验必须设置无逆转录酶对照,用来判断残留基因组 DNA 会不会产生扩增信号,区分信号来自 mRNA 还是基因组 DNA。

样本用量,根据靶基因丰度调整 RNA 上样量,不要过高。模板过量会抑制逆转录反应,一般单管逆转录总 RNA 推荐范围在 0.1μg 至 2μg。浓度过低的样本可以增加上样量,但需要保证纯度。

其他注意点,样本不能带有外源 RNase 污染,操作全程使用无 RNase 耗材。样本如果发生细菌、真菌污染,微生物释放大量 RNase,会快速降解样本 RNA,这类样本不建议使用。

精简版(可直接粘贴):
RT-PCR 样本需保证 RNA 完整性,离体组织迅速液氮速冻或置于 RNA 保护液,细胞与体液样本及时处理。样本分装保存于 - 80℃,避免反复冻融。提取后检测 RNA 纯度,A260/A280 控制在 1.8~2.1,A260/A230 大于 2.0;电泳评估 RNA 完整性。尽量去除血红蛋白、酚、多糖等 PCR 抑制物,必要时 DNase 处理降低基因组 DNA 干扰;同时设置无逆转录酶对照。控制逆转录的 RNA 上样量,避免模板过量抑制酶促反应;微生物污染、RNA 严重降解的样本不可使用。




原创作者:上海笃玛生物科技有限公司




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