1. 技术原理与实验流程
1.1遗传位标的选择
45个SNP位点在小鼠基因组上的分布如图1所示，针对各SNP位点侧翼进行引物和探针设计。
图1 48个SNP位点在小鼠基因组上的分布
1.2技术原理－－高通量PCR-LDR分型
高温连接酶检测反应技术是一种成熟的SNP分型检测方法。其原理是高温连接酶检测到模板DNA与两条探针DNA的接头处存在着碱基错配，则连接反应不能进行,如图2所示。针对这45 SNP位点，将其分成4组（图1中a,b,c,d），每组进行多重PCR-LDR分型。
1.3实验流程
实验流程见图3
2实验结果及分析
2.1测序仪检测结果
PCR-LDR 产物测序仪检测结果如图4，从图中可见，分型信号清晰唯一，无杂信号的干扰。此外，对部分位点经sanger测序验证，分型准确度为100%。
图4：测序仪检测结果（第二组为例）
2.2遗传质量检测的有效率
对10个近交系小鼠的3批样本（共66个）进行检测，结果显示，不同来源的相同品系SNP状态完全一致。45个SNP位点全出的概率为100%。表明这套方案对于实验中的样本45个SNP位点完全有效。同时所测样本在这些位点处基因型均为纯合，验证了这十个常见近交系小鼠品系为纯系。
十个品系间两两进行位点差异比较（共45对），最大差异位点数为29个，最小位点差异数7个；平均差异位点个数为19，差异位点数中值为20(图5)。由此可见45个SNP位点在这十个常见近交系小鼠品系中的鉴定效率较高。
图5 任意两个品系差异等位基因数目的分布图
3 服务流程
3.1 标准服务流程
1)客户沟通，确认检测小鼠品系以及样本数，提示实验可行性。
2) 建立实验方案，并在此过程中和客户保持密切沟通。
3) 大规模实验，有严格的指控流程保证实验结果可靠
3.2 实验数据质量控制流程
1) 所有分型信号要求信号清晰唯一，排除不确定信号干扰。
2) 每板数据中都有阴性对照，质控PCR和LDR污染数据。
3) 整个实验服务流程有15%的双盲重复对照，保证数据准确可靠。
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