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LncRNA测序(人/小鼠/鼠)10-12G

价格:¥电议

品牌名称:$brandModel.Title型号: 原产地:中国大陆 更新时间:2026/10/21 8:07:33

产品摘要:LncRNA测序(人/小鼠/鼠)10-12G
服务介绍:
lncRNA(Long non-coding RNA ,长链非编码RNA)是生物体内一类长度于200个碱基的非编码线性RNA,广泛存在与真核生物细胞中。在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,并且与癌症等多种疾病的发生发展存在密切的关系。

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详细内容

LncRNA测序(人/小鼠/鼠)10-12G

服务介绍:

lncRNA(Long non-coding RNA ,长链非编码RNA)是生物体内一类长度于200个碱基的非编码线性RNA,广泛存在与真核生物细胞中。在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,并且与癌症等多种疾病的发生发展存在密切的关系。

名称

规格

LncRNA测序(人/小鼠/鼠)10-12G

/个样

实验流程:

样本处理-TotalRNA抽提与质检-去除rRNA-构建dUTP链特异性文库-PE150测序-数据分析;

送样运输要求:

1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。

2)样品的量:新鲜组织 ≥300mg, 细胞样品≥1×107个, RNA样品需提供5μg以上的总RNA

3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。

4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。

主要问题:

1. lncRNA有什么功能?主要用于那些研究?

主要有四方面功能:第一,影响周边基因的表达;第二,调控蛋白质活动及定位;第三,产生小分子RNA;第四,对其它tRNA的调控作用。

lncRNA适用于疾病特异标志物寻找,功能基因组研究等。

2. lncRNA的建库方案?

长非编码RNA建库主要采用ribozero kit去除rRNA,根据客户需求建链特异性文库or普通文库。

3. 为什么要去rRNA?

RNA测序其实想得到的是mRNA和lncRNA的信息,但是总RNA当中绝部分都是rRNA,这些RNA的信息是无用的,所以需要去掉。

4. 什么是链特异性文库?

链特异性文库是在RNA-seq文库构建时,经过简单处理,在合成第二条cDNA链时,替换dTTP为dUTP,加上接头后降解第二条链。与普通文库相比,链特异建库可以帮助我们确定转录本来自正链还是负链,使得反义转录本的定量更为准确。

5. 为什么不用oligo(T)的方法提取RNA?

部分的lncRNA不含polyA,但是还有24%左右的lncRNA含有polyA。

6. 测序的数据量要求多少?

测序模式:2×150bp;数据量:10G/sample。

7. LncRNA-seq中的数据是否同时有lncRNA和mRNA?

根据rRNA去除的建库方案,测序结果中既包含lncRNA,也包括mRNA,所以客户在做lncRNA项目的同时,也可以利用同一套测序数据进行mRNA的分析。

8. lncRNA-seq分析内容有哪些?

分析报告包括:测序数据质量分析、参考基因组比对分析、转录组组装与新转录本预测、新长链非编码RNA预测、已知转录本和新长链非编码转录本的差异表达、长链非编码 RNA 靶标基因预测、差异基因功能分析、以及GSEA富集分析。

9. lncRNA在动物中的研究主要集中在那些方面?

lncRNA在四足动物(两栖类,爬行类,鸟类,哺乳类)中都有报到,但是主要集中在人和小鼠中,主要与癌症,神经系统类疾病以及其他综合症疾病相关,有报道的主要相关疾病列表如下:癌症(肝癌,食道癌,前列腺癌,白血病,肺癌,结肠癌,B细胞瘤,卵巢癌,乳腺癌,皮肤癌,内分泌性肿瘤),神经系统类疾病(精神分裂症,Prader-Willi综合症,自闭症),综合症类疾病(DiGeorge综合症,Russell-Silver综合症,Beckwith-Wiedemann综合症)

10. lncRNA在植物方面的研究主要有哪些?

植物方面,在拟南芥,水稻,玉米,小麦等植物中检测了lncRNA。lncRNA在植物中的调控机制可能有四种:靶基因相似,转录干扰,RPC2相关的组蛋白和DNA甲基化,主要与植物开花,雄性不育,胁迫反应,营养代谢相关。

热门标签:LncRNA测序(人/小鼠/鼠)10-12G

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