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技术文章
上海信帆生物：单细胞水平的miRNA表达谱分析
点击次数：3739 发布时间：2016/5/19 21:52:52
生物通报道 Fluidigm公司近日宣布在其C1™ 单细胞自动制备系统上添加miRNA表达谱分析方案，有助于揭开单细胞中miRNA的秘密。这一方案为研究人员带来了简单、快速且灵活的流程，可扩增单个细胞中数百个miRNA，同时平行处理96个细胞。
这也是Fluidigm在C1系统上实现的第三个单细胞基因组学应用。之前，它推出了单细胞mRNA测序和单细胞基因表达分析。C1系统在去年上市，基于Fluidigm创新的微流体技术，能够让研究人员快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。
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microRNA（miRNA）这个小小的非编码RNA分子，行使着重要的调控功能。研究表明，miRNA可调控数千个蛋白编码基因，从而参与了多个生物学过程，包括分化、发育和细胞周期管理。miRNA还与许多常见病存在关联，如癌症和心血管疾病。
研究人员都希望揭开miRNA的更多秘密，然而，miRNA表达谱分析也存在两方面的挑战。首先，单个miRNA可靶定多个mRNA靶点，从而调控多个生物学系统。这种生物学现象是细胞间差异的一个促进因素，让miRNA靶点的解释变得困难。在单细胞水平研究miRNA的表达让研究人员可测定同一群体中某些细胞所发生的快速、动态变化。其次，传统的芯片分析费时费力，灵敏度不高，且内容不够灵活。而定量PCR虽提供了比芯片更高的灵敏度，但在研究时成本高、时间长。
如今有了C1系统和miRNA表达谱分析方案，研究人员可在不到24小时的时间内，平行处理96个单细胞，在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析软件可以对数据进行非监督式聚类分析及PCA分析，有效地根据miRNA表达类型在单细胞水平揭示细胞群体的异质性，为研究miRNA调控提供更多数据。
C1单细胞全自动制备系统是全先推出的全自动单细胞分离和制备系统。C1系统为每次运行处理96个单细胞提供了简单轻松、高度重复的流程，而手工操作所需的时间少。它前所未有地让分离细胞、提取、逆转录和扩增过程实现全面自动化，使细胞活性的检测和分析成为可能，并减少了多平台技术错误所引起的可变性。了解更多信息
Fluidigm公司单细胞基因组学业务的主管Candia Brown表示：“Fluidigm一直致力于扩我们的单细胞应用菜单，这样研究人员就能在系统水平探索细胞网络。我们的客户需要一个扩展的工具包，以便探索生物学通路中的基因表达和基因调控。通过添加单细胞miRNA表达工具，我们为回答这些复杂的问题带来了简约、快速和。”
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原创作者：上海信帆生物科技有限公司
