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目前，分子生物学正在并最终肯定会让我们对整个生命科学有一个全面而彻底的认识，其对免疫测定技术发展的影响也是直接而又有效的，它使我们对以前一些难以检测的生物活性物质的测定变得轻而易举，并且大大提高了检测的灵敏度和特异性。
较早用于免疫测定的基因工程抗原是HBcAg和HBsAg，这两种基因工程抗原的出现，较好地解决了抗HBc和HBe的测定问题。因为要从病毒本身去大量获取这两种纯抗原较为困难，并且这一点对于难培养的病原微生物来说，如HIV、HCV和梅毒螺旋体等都有些共性。
一、HCV-ELISA
HCV目前尚不能体外培养，只能用基因工程或化学合成方法获取HCV结构和非结构区的各种抗原片断，已知HCV基因组有7个功能区组成：核心、E1、E2/NS1 NS2 NS3 NS4 NS5（有分为NS5a和NS5b）区，合成抗原的优点是易于纯化，特异性好，抗原抗体反应强。
二、第一代抗HCV-ELISA
由美国ortho公司克隆C1003抗原几个片断与人超氧化物歧化酶（SOD）结合。用酵母从病毒基因组非结合区得到表达，表达为融合蛋白，亦作为包被固相载体。
抗原组合：NS4 区二个基因片断为NS 5-1-1和C1003
特性：IgG抗C100在发病后数月后，才检出，故不宜作早期诊断。
约由20%的病人不出现抗体。IgM抗-C100急性期检出率只有64%。
C100的抗原性较弱，在HCV复制中，不能充分暴露宿主的免疫系统。
特异性和灵敏性较差。
三、第二代HCV-ELISA试剂盒
用基因重组的HCV结构蛋白与非结构蛋白抗原包被固相载体。
抗原组合：核心区（C区）多肽C22 NS区多肽C33 C1003和NS 5-1-1
增加C22区和C33区后，抗体出现早，有助早期诊断，提高阳性率。有利早期诊断。
C22是早期易出现病毒血症
四、第三代HCV-ELISA试剂盒
人工合成多肽抗原，由36个氨基酸组成的Cp9（内壳蛋白）和19个氨基酸组成Cp10混合包被固相载体。
抗原组合：除有C 100-3 C22 C33 外又增加了core 和NS3 NS4 NS5
特点：
① core NS3 NS5由Baculovirus 重组表达，没有非特异性的载体，试剂特异性高，重组的蛋白经融合形成大分子抗原，利于提高检测灵敏度。
② NS3 区增加了氨基酸片断（比例十分重要）。改进了反映的灵敏度。
③ NS5 经优化，徐去了非特异性的区域（G-D-D）NS3 NS5是血转化最早测得的抗体，提高了诊断的准确性。
④ NS4 为俩个片断的合成多肽，去掉了非特异性反应的区域，加强了试剂的灵敏度和特异性。
五、第四代HCV-ELISA 试剂盒
美国新近推出一种包括HCV基因组7个功能区所有免疫决定基的单一融合蛋白，称为多决定基融合抗原，采用表面活性剂处理分界病毒表面复合物，释放HCV核心抗原（core）并用ELISA法，灵敏度可达500拷贝/ml，已接近核酸扩增检测水平。
抗原组合：以Core和NS3作为主要检测片断（比例十分重要）加合成多肽NS4
特点：
① 直接测Core抗原；
②不易发生变异；
③ 抗IgM 和IgG检出率可达100%；
④ 特异性达99。8%灵敏度为100%。
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