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TruSeq 接头中独特分子标识符的整合提高了定量测序的精确性

点击次数：4970 发布时间：2017/12/25 9:11:56

二代测序数据的定量分析要求区分重复读长，重复读长在PCR过程中由具有独特起源的相同分子产生。通常PCR复制被定义为序列读取，它以对齐为依据，对齐到相同的基因组坐标上。然而，在文库构建期间，相同的分子能够独立产生。作为PCR的复制品，分析时这些分子的错误识别能够产生不可预见的偏爱。美国纽约大学科学家开发了一种性价比高的序列接头，通过改进Illumina公司TruSeq接头，结合独特分子标识符（UMI）的设计，可以维持进行多重、单一指标测序的能力。UMIs结合到TruSeq接头（即TrUMIseq 接头）能够识别真正的PCR产物，这些PCR产物带有相同UMIs作为相同的图谱读取。使用TrUMIseq 接头，在使用DNA测序的各种人群中和使用RNA测序的基因表达定量中， PCR复制品的精确移除提高了等位基因频率估计的精确度和RNA测序基因表达定量。
原文：
Jungeui Hong BioTechniques 63:221-226 （November 2017）and David Gresham. Incorporation of unique molecular identifiers in TruSeq adapters improves the accuracy of quantitative sequencing.

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