企业档案
会员类型：旗舰版
已获得阿仪网信誉 等级评定
(0 -40)基础信誉积累，可浏览访问
(41-90)良好信誉积累，可接洽商谈
(91+ )优质信誉积累，可持续信赖
阿仪网旗舰版会员：3年
工商认证 【已认证】
最后认证时间：
注册号： 【已认证】
法人代表： 【已认证】
参观次数：742505
技术文章
上海富衡 | 单细胞测序中细胞通讯分析方法
点击次数：2040 发布时间：2025/7/14 9:33:04
细胞通讯对生物功能至关重要，单细胞测序为其研究提供了有力工具。以下简述该技术下的细胞通讯分析方法。
配体 - 受体对分析法
数据库匹配鉴定：借助 CellPhoneDB、iTALK 等数据库，将单细胞测序数据中配体与受体基因表达信息，与库内已知的配体 - 受体对进行比对，识别细胞通讯事件。比如在肿瘤研究中，可借此发现肿瘤细胞与免疫细胞间的免疫逃逸通讯机制。
表达模式推断：依据配体、受体在不同细胞类型的表达模式推断通讯。若一种细胞高表达配体，相邻细胞高表达相应受体，则二者可能存在通讯。此方法有助于发现新的配体 - 受体相互作用，如神经系统发育研究中潜在的新通讯机制。
细胞通讯网络构建法
基因表达相关网络：分析不同细胞类型基因表达相关性，关联表达模式相似基因（含配体 - 受体对基因）构建网络。节点为细胞类型，边表示通讯关系，边的权重反映配体 - 受体对表达相关性强度。像胚胎发育研究，该网络可展示细胞通讯动态变化。
结合空间信息网络：单细胞测序结合空间转录组技术，把配体 - 受体对表达与细胞空间位置结合构建网络。此方法考虑细胞物理距离对通讯影响，例如在肝脏研究中，能明确不同细胞在空间上的通讯联系。
功能富集分析法
信号通路富集：对参与细胞通讯基因进行信号通路富集分析，与 KEGG 等数据库比对，确定显著富集的信号通路。如炎症研究中，发现细胞通讯富集于 NF - κB 信号通路，揭示其在炎症调控作用。
生物学功能富集：分析细胞通讯基因富集的生物学功能，如增殖、分化等，深入理解细胞通讯对细胞生理功能影响。例如肿瘤研究中，发现肿瘤与基质细胞通讯富集于细胞增殖功能，为治疗提供靶点。
单细胞测序下细胞通讯分析方法多样，从配体 - 受体对分析到网络构建，再到功能富集，综合运用可揭示细胞通讯机制，助力生命科学研究与疾病治疗。
原创作者：上海富衡生物科技有限公司
