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GMO外源aacc4基因探针法qPCR试剂盒
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详细内容
GMO外源aacc4基因探针法qPCR试剂盒
产品特点
GMO外源aacc4基因探针法qPCR试剂盒用PCR筛查转基因植物的时候,通常选择外源启动子、外源功能基因或外源终止子等GMO元件作为靶分子。如果待测样本中有上述靶分子存在,就可以初步断定该样本中有转基因成分。来于来于具有庆大霉素抗性的细菌菌株的aacc4(aminoglycoside 3'-N-acetyltransferase,庆大霉素3-N-乙酰转移酶)基因,就是常用的GMO外源功能基因,该基因并不存在于天然的植物细胞中。由于其编码的酶可以降低抗菌活性,因而可以用作筛选标记。本产品就是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门筛查GMO材料中外源aacc4基因的试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供DNA样品。
2. 引物和探针经过优化,分析灵敏性高,可以达到100拷贝/µL。
3. 特异性高,根据GMO外源aacc4基因保守区域设计引物和探针,不会跟其他基因发生交叉反应。
4. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
5. 所用探针为FAM标记,可以跟其他荧光标记的GMO PCR检测组合成多重检测。
6. 快速,整个检测过程(按一个样品计)所需时间仅2小时。
7. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。
8. 本产品足够50次20 µL体系的探针法荧光定量PCR。
9. 本产品只可用于科研。
成分 | 规格 | 包装 |
2×Probe qPCR MasterMix | 0.5mL | 0.5mL本色管 |
荧光PCR专用模板稀释液 | 1mL | 1.5mL绿盖管 |
GMO外源aacc4基因探针法qPCR引物-探针混合干粉 | 50次 | 0.5mL棕色管 |
GMO外源aacc4基因探针法qPCR阳性对照(1E7拷贝/µL) | 50µL | 0.5mL黄盖管 |
超纯水 | 1mL | 1.5mL蓝盖管 |
使用手册 | 1份 | 无 |
本产品采用五孔盒包装 | ||
注意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入165uL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。 | ||
一、稀释标准曲线样品(以阳性对照1E1-1E6拷贝/µL这6个10倍稀释度和内参固定在1E3拷贝/µL为例。
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。
1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
2. 用带芯枪头分别加入45 µL荧光PCR专用模板稀释液,用带芯枪头,下同)。
3. 在6号管中加入5 µL阳性对照(浓度为1×1E7拷贝/µL,本试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/µL的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在5号管中加入5 µL 1E6拷贝/µL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/µL的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在4号管中加入5 µL 1E5拷贝/µL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得 1E4拷贝/µL的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品DNA的制备
7. 如果有N个样品,设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 µL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的样本起始体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。如果有N个样品,则需要进行N+2个样品提取,多出的一个用作样品制备阳性对照管、另一个用作样品制备阴性对照管。
8. 用自选方法纯化样品的DNA,本产品跟市场上绝大多数核酸纯化产品兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。

三、Probe qPCR反应(20 µL 体系,在样品制备室进行)
9. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第一步稀释得到的标准曲线系列稀释液的第3号做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后加):
成分 | 样品管 | PCR | 标准曲线样品管 |
2×Probe qPCR MasterMix | 各10µL | 10µL | 各10µL |
GMO外源aacc4基因探针法qPCR引物-探针混合液 | 各3µL | 3µL | 各3µL |
N+2个待测DNA样本 | 各7µL | 不加 | 不加 |
超纯水 | 不加 | 7µL | 不加 |
第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号) | 不加 | 不加 | 各7µL |
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程 | 温度 | 时间 |
预变性 | 95℃ | 3min |
PCR反应 (40个循环) | 95℃ | 10sec |
58℃ | 5sec | |
60℃ | 5sec | |
72℃ | 1min(采集FAM通道的荧光信号,淬灭基团为TAMRA) |
GMO外源aacc4基因探针法qPCR试剂盒
四、数据处理
12. 如果样本制备阳性对照或PCR阳性对照(包括标曲样本)结果为阴性,则整个实验无效,不需要分析数据,需要重新样本制备,重新进行PCR扩增或跟厂家联系。如果样本制备阴性对照或PCR阴性对照结果为阳性,说明环境污染,则整个实验无效,不需要分析数据,需要跟厂家联系。
13. 如果阴性对照和阳性对照均正常,则实验有效,可以进入后续分析。
14. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以FAM通道的Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的FAM通道的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
15. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照FAM通道的Ct必须没有读数,或者大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,FAM通道的Ct值应该小于40。对待测样品,如果其FAM通道的Ct没有读数、大于或等于40则均为阴性,如果小于40则为阳性。
自备试剂
样品DNA
运输及保存
低温运输,-20℃保存,有效期2年
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