英文名称：SIMA-dT phosphoramidite,6-isomer

中文名称：SIMA 亚磷酰胺，6-异构体，6-异构体 SIMA标记胸腺嘧啶脱氧核苷亚磷酰胺

CAS 号：1411797-05-1

分子式：C58H64Cl2N3O10P

分子量：1065.02

Purity：95%+

Appearance：solid/powder

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结构式：

产品介绍：

SIMA phosphoramidite, 6-isomer是一种用于DNA/RNA固相合成的荧光标记亚磷酰胺单体，由陕西新研博美生物科技供应。该试剂属于T染料类荧光标记单体，光谱特性与HEX相似，但量子产率更高，且在碱性条件下脱保护时具有更强的稳定性。作为纯化的6-异构体，该产品避免了混合异构体可能引入的标记异质性和光谱差异，确保标记结果的一致性和可重复性，批次稳定性，实验重复性好。其偶联条件与标准亚磷酰胺完全兼容，可直接用于自动化DNA合成仪，适配主流合成平台与检测仪器。

作用机理

SIMA phosphoramidite, 6-isomer的结构由三部分组成：SIMA荧光团、脱氧胸苷（dT）骨架和亚磷酰胺反应基团。SIMA全称5-羧基-2′,4′,5′,7′-四溴-4,7-二氯荧光素，四个溴原子和两个氯原子的引入使其发射光谱显著红移至黄橙色至红色区域。

反应流程分为三步。步，偶联。在DNA合成仪上，亚磷酰胺末端的二异丙基氨基氰乙氧基磷在弱酸性活化剂（如四唑）作用下，与固相载体上寡核苷酸链5′端的游离羟基发生亲核取代反应，形成亚磷酸酯键，随后氧化为稳定的磷酸三酯。第二步，封端。未反应的5′-OH被乙酰化封端，防止缺失序列产生。第三步，脱保护与切割。合成完成后，使用浓氨水或AMA处理，将寡核苷酸从CPG上裂解并去除保护基团，得到5′端SIMA标记的寡核苷酸探针。偶联时间建议延长至5至10分钟以确保高效掺入。

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（文章资料汇总来源于：陕西新研博美生物科技小编木木）