英文名称：JOE phosphoramidite,5-isomer

中文名称：JOE 磷酸酰胺,5-异构体

分子式：C48H60N3Cl2O12P

分子量：972.88

激发波长（Ex）：约520 nm

发射波长（Em）：约548 nm

Purity：95%+

Appearance：solid/powder

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结构式：

产品介绍：

JOE phosphoramidite, 5-isomer是一种用于寡核苷酸固相合成的荧光标记亚磷酰胺单体，由陕西新研博美生物科技供应。该试剂将JOE荧光染料（5-羧基-4,7,2',7'-四氯荧光素）与磷酰胺活性基团通过柔性连接臂整合为一体，可在标准自动化DNA/RNA合成仪上直接掺入寡核苷酸链的5'末端或内部特定位点，形成稳定的磷酸二酯键。标记位点可控、产物均一，批次间一致性，实验重复性好。其偶联动力学与标准亚磷酰胺单体一致，完全兼容主流合成平台与检测仪器。JOE的发射波长位于FAM（约520 nm）与TAMRA（约580 nm）之间，是多色荧光检测体系中不可替代的中间通道染料。该试剂科研使用，不可用于人体。

作用机理

JOE phosphoramidite, 5-isomer的结构由三部分组成：JOE荧光核心、柔性连接子和亚磷酰胺活性基团。JOE属于T类染料，四个氯原子和两个甲氧基的取代使其吸收和发射光谱精确落在橙黄色区域。5-异构体的设计优化了共轭体系，确保荧光信号亮度高、化学均一性好，同时在固相合成的酸性和碱性条件下均保持稳定。

反应流程遵循标准亚磷酰胺化学循环。步，脱保护。合成仪用酸性溶液去除生长链5'端的DMTr保护基，暴露游离羟基。第二步，活化。0.3 M BMT（苯基巯基四唑）乙腈溶液将亚磷酰胺基团活化，生成高活性的四唑中间体。第三步，偶联。活化后的JOE phosphoramidite与5'端羟基发生亲核取代反应，形成亚磷酸酯键，偶联时间建议180秒。第四步，氧化。碘溶液将亚磷酸酯氧化为稳定的磷酸三酯。第五步，封端。未反应的5'-OH被乙酰化封闭，防止缺失序列产生。循环至序列完成后，使用浓氨水或AMA在60°C下处理约5小时，同时完成脱保护和从CPG上切割，得到5'端标记JOE的寡核苷酸产物。

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（文章资料汇总来源于：陕西新研博美生物科技小编木木）