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英文名称：SIMA phosphoramidite,6-isomer

中文名称：SIMA 亚磷酰胺,6-异构体，6-异构体 SIMA标记胸腺嘧啶脱氧核苷亚磷酰胺

CAS 号：1411797-05-1

分子式：C58H64Cl2N3O10P

分子量：1065.02

结构式：

纯度：95%，详情可在线咨询

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保存建议： 需要存储在-20°C，避光，避湿的环境。

注意事项：不要让产物进入下水道，本品仅供科研用途。

产品介绍：

SIMA-dT phosphoramidite, 6-isomer，CAS号1411797-05-1，中文名称为6-异构体SIMA标记胸腺嘧啶脱氧核苷亚磷酰胺。分子式C₅₈H₆₄Cl₂N₃O₁₀P，分子量1065.02，纯度≥95%，外观为固体，溶于DMSO。

该分子由三个功能模块有序串联而成：

SIMA荧光团——6-异构体形式。 SIMA全称5-羧基-2′,4′,5′,7′-四溴-4,7-二氯荧光素。四个溴原子和两个氯原子的引入使其发射光谱显著红移至黄橙色至红色区域，激发波长531–572 nm，发射波长555–592 nm。这一光谱位置恰好位于JOE（~548 nm）与TAMRA（~583 nm）之间，是构建多色荧光检测体系的理想中间通道染料。其荧光量子产率高，消光系数大，标记后信号明亮，光稳定性强，在持续光照下荧光强度衰减缓慢。

脱氧胸苷（dT）骨架。 作为核酸碱基类似物，在固相合成中替代天然dT掺入寡核苷酸链，不影响Watson-Crick碱基配对。SIMA通过连接臂固定于dT的C5位，在DNA双链中位于大沟位置，不干扰碱基配对和双链稳定性，保持探针的杂交性能。

亚磷酰胺反应基团。 位于分子末端（二异丙基氨基氰乙氧基磷），作为固相合成反应位点，可与DNA合成柱上的核苷酸发生高效偶联反应。其偶联条件与标准亚磷酰胺完全兼容，可直接用于自动化DNA合成仪，偶联时间建议延长至5–10分钟以确保高效掺入。

"6-异构体"这一限定至关重要。6-isomer是寡核苷酸固相合成的标准异构体，偶联效率和合成产率均优于5-isomer。作为纯化的单一异构体，它避免了混合异构体产品可能引入的标记异质性和光谱差异，确保标记结果的一致性和可重复性，对高效液相色谱纯化和质谱分析尤为关键。

产品介绍：

SIMA-dC phosphoramidite

SIMA-dA phosphoramidite

SIMA-dG phosphoramidite

C6-SIMA-dT phosphoramidite

C6-SIMA-dC phosphoramidite

C6-SIMA-dA phosphoramidite

C6-SIMA-dG phosphoramidite

5-SIMA-dU phosphoramidite

5-SIMA-dT phosphoramidite

TAMRA-dT phosphoramidite

TAMRA-dC phosphoramidite

FAM-dT phosphoramidite

FAM-dC phosphoramidite

HEX-dT phosphoramidite

TET-dT phosphoramidite

Cy3-dT phosphoramidite

Cy5-dT phosphoramidite

BODIPY FL-dT phosphoramidite

ROX-dT phosphoramidite

ATTO 488-dT phosphoramidite

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