单细胞的染色质构象_公司新闻_上海谷研实业有限公司

对于理解基因调控、DNA复制和修复来说，研究染色体的结构性质和空间组织尤为重要。染色质构象捕获（3C）技术在近年来被广泛使用，并衍生出更多技术，如4C、5C和Hi-C。3C技术利用甲醛来交联染色质，在酶切消化后原位连接，并以高通量的方式来评估染色质纤维的接近程度。这种方法分辨率高，但需要大量细胞。相反，DNA FISH可实现单细胞的研究，但3-D分辨率较低。

它不仅能够以高于显微镜的分辨率探索染色质纤维的接近程度，还能对细胞群体中这一特征的频率进行分析。这种新方法利用原位邻位连接分析（ISPLA）的特点，但不需要滚环扩增（RCA）。因此，它克服了细胞核亚结构所带来的空间位阻，提供了连续的信号。

以地高辛或生物素标记的DNA探针与甲醛固定的细胞杂交，接着是一抗检测。当带有不同寡核苷酸DNA序列的二抗与一抗结合时，添加骨架（长接头）和荧光标记的碎片（短接头）寡核苷酸。如果两个不同二抗之间的距离小于170Å，则它们各自的寡核苷酸足够靠近，让骨架和碎片寡核苷酸可同时连接，并zui终形成一个荧光标记的环状DNA分子。