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上海雅吉生物科技有限公司 主营产品:ELISA试剂盒,免疫组化试剂盒,PCR检测盒,金标试纸,发光试剂盒,抗体,血清,细胞等

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当前位置:阿仪网>上海雅吉生物科技有限公司>技术文章>火鸡星状病毒探针法荧光定量RT-PCR试剂盒

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技术文章

火鸡星状病毒探针法荧光定量RT-PCR试剂盒

点击次数:3293 发布时间:2023/11/29 8:13:35

产品及特点

禽星状病毒属成员均感染禽类。病毒感染经常涉及肠道之外的损伤,例如对肝、肾或免疫系统的伤害。鸭星状病毒通常引起鸭的致死性肝炎。星状病毒感染火鸡和鸡影响多个组织,包括肾和淋巴。在羊膜囊中盲传后,病毒可在受孕的禽卵中生长。种型有鸡星状病毒(Chicken astrovirus ),火鸡星状病毒 1 型(Turkey astrovirus 1),火鸡星状病毒 2 型(Turkey astrovirus 2)等。本产品就是以探针法荧光定量 RT-PCR 技术为基础开发的门检测火鸡星状病毒型的试剂盒,它具有下列特点:

1. 即开即用,用户只需要提供样品RNA模板。

2. 引物和探针经过优化,分析灵敏性高。

3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。

4. 特异性高,引物是根据火鸡星状病毒高度保守区设计,不会跟其他病毒的RNA发生交叉反应。

5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量。

6. 本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量RT-PCR反应。

7. 本产品只能用于科研。

规格及成分

成分

编号

A

190504a

B

190504b

C

180701

D

15-54400yp

E

54400pc

使用手册

15-54400sc

运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

自备试剂

样品RNA,超纯水。

使用方法

一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA段作为阳性对照。

1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。

2. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光RT-PCR用模板稀释液,好用带芯枪头,下同。

3. 在6号管中加入5 μL 1×10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

4. 换枪头,在5号管中加入5 μL 1×10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

5. 换枪头,在4号管中加入5 μL 1×10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

二、样品RNA的制备

7. 如果有N个样品,好设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)和NC(样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC。另外用水作为NC。

8. 用自选方法纯化样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒RNA提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的柱式病毒RNAout或免提取核酸释放剂。

三、Probe qRT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)

9. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),1个用于RT-PCR阳性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。

10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后后加):

成分/每管

样品管

N+2个

RT-PCR阴性对照

标准曲线样品管

(1-6管)

A

10 μL

10 μL

10 μL

B

2 μL

2 μL

2 μL

D

3 μL

3 μL

3 μL

N+2个待测RNA样本

5 μL

不加

不加

自备超纯水

不加

5 μL

不加

第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号)

不加

不加

5μL(1号样到1号管,2号样到2号管…)

11. 盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:

过程

温度

时间

逆转录

50℃

20 min

预变性

95℃

10 min

RT-PCR反应

(45个循环)

95℃

15 sec

57℃

30 sec

72℃

30 sec(采集FAM通道的荧光信号)

五、数据处理

12. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。

13. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于36。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于36则为阳性。如果在36-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。

原创作者:上海雅吉生物科技有限公司

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