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技术文章
新产品IANSeq核糖体RNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)
点击次数:3623 发布时间:2021/5/24 8:57:36
产品简介
TIANSeq rRNA Depletion Kit (H/M/R) 采用特殊设计的DNA探针与核糖体RNA(rRNA)杂交,随后利用Ribo RNase H降解DNA-rRNA杂交链中的rRNA,从而去除人、小鼠、大鼠总RNA中的细胞质核糖体RNA(28S、18S、5.8S、5S)和线粒体内核糖体RNA(16S、12S),保留信使RNA(mRNA)和其它非编码RNA。
该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果,所获得的去除了rRNA的RNA样本可用于mRNA和非编码RNA高通量测序,可显著提高测序结果中有效数据比例,纯化产物也可用于随机引物cDNA合成或其它下游应用。
产品特点
样本广泛:适用于高质量(完整)及部分降解(如FFPE)样本中rRNA的去除。
高效去除:有效去除95~99.9%的人/小鼠/大鼠的rRNA。
数据全面:保留了不完整mRNA和非编码RNA信息,使转录组数据更加全面。
快速评估:试剂盒中提供的引物可快速评估rRNA的去除效果。
操作流程示意图

实验例

RNA纯化
推荐使用磁珠纯化产品TIANSeq RNA Clean Beads (TIANGEN Cat#NG307),也可使
用Agencourt RNAClean XP (Beckman Coulter)。
1. 涡旋振荡混匀TIANSeq RNA Clean Beads,吸取110 μl (2.2倍体积) 至步骤三的50 μl
RNA产物,用移液器吸吹混匀10次。
2. 室温静置15 min,使RNA充分结合到磁珠上。
3. 将样品置于磁力架上5 min,待溶液澄清后,用移液器小心移除上清。
4. 保持样品始终处于磁力架上,加入200 μl新鲜配制的80%乙醇 (每次实验需要新鲜配
制,因为乙醇易从空气中吸收水分,浓度降低影响实验效果)漂洗磁珠 (不要吹散磁
珠) ,室温孵育30 sec,小心移除上清。
5. 重复步骤4进行漂洗。
6. 取出离心管短暂低速离心 (<2000 g, 10 sec) ,使液体收集至管底,将样品放回磁力架,
用移液器小心弃去所有液体。
7. 保持样品始终处于磁力架上,开盖晾干磁珠3~5 min (不要过度干燥,否则可能降低
RNA回收率。洗脱应当在磁珠依然显深棕色且光亮,而且所有可见液体已完全挥发时进
行。若磁珠出现裂缝,则表示已过度干燥)。
8. 将样品从磁力架上取出,加入6.5 μl RNase-Free ddH2O ,用移液器吹打10次混匀磁珠,
室温静置2 min。
注意:上述洗脱体积适用于TIANSeq RNA文库构建试剂盒NR102或NR103,如搭配其他
RNA建库产品,请根据产品说明书选择合适的洗脱体积。
9. 在磁力架上静置2 min,待溶液澄清后,不要触动磁珠,小心吸取5 μl上清 (可根据步骤8
选择的实际洗脱体积进行相应调整,尽量充分利用洗脱产物)至新的Nuclease-Free PCR
管。
10. 洗脱样品可立即用于RNA测序文库构建或其他分析应用,也可在-20℃保存过夜或
在-80℃保存30天。
原创作者:上海雅吉生物科技有限公司






