产品及特点肠道病毒 71 型(Enteric Virus-71,EV-71)是引起婴幼儿手足口病主要病原体之一,还可引起无菌性脑膜炎、脑干脑炎和脊髓灰质炎样的麻痹等多种神经系统疾病。手足口病感染初期患者表现为低热、流涕、食欲下降、口痛、呕吐、腹泻等。口腔黏膜出现小疱疹,在口腔病变的同时皮肤可以出现斑丘疹,以手足为多见,皮疹主要分布于手背、指间,该病多发生于 5 岁以下儿童,1~2 岁幼儿发病率最高,因此灵敏快捷的诊断产品具有重要的意义。本产品基于 PCR 原理开发。它具有下列特点: 1.一站式,用于不需要单独准备每种成分,包括引物和对照。 2.根据肠道病毒 71 型的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性。 3.基于染料法 qRT-PCR 检测,灵敏度比常规 RT-PCR 高 10-100 倍,可以达到至少 1000 拷贝/反应。 4.使用一管式 qRT-PCR 技术,RT 和 PCR 两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。 5.本产品足够 50 次 30μL 体系的 RT-PCR,只能用于科研,不能用于临床。 规格及成分成份编号十孔盒包装 2×qRT-PCR 缓冲液190101a500 μL(棕色管) 10×qRT-PCR 酶混合液190101b100 μL(红盖) ROX 染料I190101c50 μL(棕色管) ROX 染料 II190101d50 μL(棕色管) 荧光PCR 专用模板稀释液1807011mL(亮黄盖) 肠道病毒 71 型 RT-PCR 引物混合液14-52900yw100 μL(白盖) 肠道病毒 71 型 RT-PCR 阳性对照 (1×10E8 拷贝/μL)14-52900pc50 μL(黄盖) 天净沙核酸释放剂试用装6120220 次(1mL,绿盖) 使用手册14-52900sc1 份 运输及保存低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。阳性对照需要因易污染其他成分需 要单独放置。本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供 DNA 片段作为阳性对照 自备试剂样品 RNA 使用方法一、稀释阳性对照(以 10E2-10E7 这 6 个 10 倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。为增加产品稳定性和避免扩 散传染性病原。
1.标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
2.在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(本试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
3.换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
4.换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品 RNA 的制备
5.如果有 N 个样品,必须设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 上步制备的阳性对照梯度稀释液中的第 4 号(浓度为 1×10E4 拷贝/μL,10μL 相当于 1 万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。
6.用自选方法纯化 N+2 个样品的 RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 RNA 提取试剂盒兼容。本试剂盒免费赠送 20 次免 RNA 提取的天净沙核酸释放剂试用装,其使用手册可以从本公司网站 www.tiandz.com,通过搜索产品名称天净沙核酸释放剂或产品编号 61202 下载。
三、设置 RT-PCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)
7.如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照,6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号阳性对照稀释液做模板)。下面只描述定量分析的步骤,定性分析只是把 6 个标曲反应缩减成 1 个,其余不变。
8.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设
置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分N+2 个制备
所得样品RT-PCR
阴性对照RT-PCR 阳性
对照(2-7 管)
2×qRT-PCR 缓冲液10μL10μL各 10μL
口蹄疫病毒 RT-PCR
引物混合物2μL2μL各 2μL
50×ROX (见注)0.4μL0.4μL各 0.4μL
样品制备所得 RNA 模
板(来于第 8 步)5.6μL不加不加
稀释所得 6 个阳性对照
(来于第 6 步)
不加
不加各 5.6μL(2 号样到 2 号管,3 号样
到 3 号管…)
10×qRT-PCR
酶混合液2μL2μL2μL
注:需使用 ROX 染料I 的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。
需使用 ROX 染料 II 的机型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research
的 Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。
不需要使用 ROX 的机型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。
9.上机后按下面参数进行 RT-PCR(参数可能会因
仪器不同而需优化)。
四、数据处理
10.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
11.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于
或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等
于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。重复实验的 Ct 值如果大
于或等于 40 则为阴性,如果小于 40,则为阳性。
关联产品肠道病毒 71 型可视化 RT-LAMP 检测试剂盒
原创作者:上海雅吉生物科技有限公司