猪葡萄球菌PCR阳性对照的配制需根据对照类型(DN段/活菌悬液) 选择方案,以下是分步操作指南,确保对照稳定性和实验可靠性:
一、DN段阳性对照配制(推荐,稳定性高)
DN段是PCR阳性对照最常用的形式,适用于检测猪葡萄球菌特定基因(如16S rRNA基因、毒力基因cap、血清型基因slt/spa等)。
步骤1:菌株选择与培养
菌株选择:优先选择猪源猪葡萄球菌标准菌株(如ATCC 49225(1型)、CMCC 50004(2型)),确保与检测样本来源一致(避免物种差异导致假阴性)。
培养条件:
接种菌株于血琼脂平板或LB液体培养基,37℃、5% CO₂培养24~48小时(至对数生长期,OD600≈0.6)。
若为固体培养,挑取单菌落接种至LB液体培养基(含10%胎牛血清),37℃振荡培养(200 rpm)12小时。
步骤2:基因组DNA提取
方法选择:使用商用细菌基因组DNA提取试剂盒(如TIANGEN DP301、Omega Biotek D5625),按说明书操作:
离心收集菌体(12000 rpm,2分钟),弃上清;
加入裂解液(含蛋白酶K),55℃孵育30分钟;
加入结合缓冲液,过柱洗涤;
洗脱DNA(用TE缓冲液pH 8.0,避免纯水导致DNA降解)。
质量检测:
浓度:NanoDrop检测,推荐工作浓度10100 ng/μL(A260/A280≈1.82.0,无蛋白污染);
完整性:1%琼脂糖凝胶电泳,应出现清晰单一条带(无弥散拖尾)。
步骤3:目标片段PCR扩增
引物选择:根据检测目标选择特异性引物(如16S rRNA基因引物、cap毒力基因引物、slt(1型)/spa(2型)血清型引物)。
PCR体系(25μL):
基因组DNA模板:1~10 ng;
2×Taq Master Mix:12.5 μL;
上游/下游引物(10 μM):各0.5 μL;
无菌水:补足至25 μL。
PCR程序:
95℃预变性5分钟 → 95℃ 30秒 → 55~60℃ 30秒 → 72℃ 1分钟/kb(循环30次) → 72℃延伸5分钟。
产物纯化:用PCR产物纯化试剂盒(如TIANGEN DP300)去除引物、dNTPs,洗脱DNA(TE缓冲液,-20℃保存)。
步骤4:分装与保存
将纯化后的DN段分装至无菌EP管(每管1050 μL,避免反复冻融),-20℃保存(可稳定12年)。
标记信息:菌株名称、基因片段大小、制备日期、保存条件。
二、活菌悬液阳性对照配制(适合需验证活性的场景)
活菌悬液适用于需检测“活菌感染”或“菌体代谢活性”的实验,但稳定性低于DN段。
步骤1:菌株复苏与活化
从甘油保藏管(-80℃,含15%~25%甘油)中取100 μL猪葡萄球菌菌株,接种至5 mL LB液体培养基(含10%胎牛血清),37℃、200 rpm振荡培养12小时(至对数生长期)。
步骤2:菌体收集与重悬
离心收集菌体(12000 rpm,2分钟),弃上清;
用无菌PBS(pH 7.4)重悬菌体,调整浓度至10⁸ CFU/mL(用平板计数法验证:取10 μL菌悬液涂布LB平板,37℃培养24小时,单菌落数应为10⁶~10⁸ CFU/mL)。
步骤3:甘油保藏液配制
配方:LB缓冲液(含10%胎牛血清)+ 20%甘油(终浓度)+ 100 U/mL青霉素 + 10 μg/mL链霉素(抑制杂菌)。
操作:取100 μL菌悬液加入400 μL甘油保藏液,混匀后分装至无菌冻存管(每管100~200 μL)。
步骤4:冷冻与保存
程序降温:将冻存管置于-80℃冰箱,缓慢降温至-20℃(避免冰晶损伤菌体),再转移至-80℃长期保存(可稳定5年以上)。
短期使用:4℃保存不超过24小时(需添加抗生素抑制杂菌)。
三、关键注意事项
猪源适配性:优先选择猪源菌株(如ATCC 49225),避免使用牛、人源菌株(可能存在序列差异,导致假阴性)。
避免污染:
操作全程在超净台内进行,使用无菌耗材;
阳性对照单独存放(远离样本区),使用专用移液器。
定期验证活性:
DN段:每6个月用阳性对照进行PCR扩增,确认Ct值在20~30之间(正常范围);
活菌悬液:每3个月涂布平板验证菌体存活率(单菌落数≥10⁶ CFU/mL)。
添加剂选择:
DN段:用TE缓冲液(含0.01% EDTA)保存,抑制核酸酶活性;
活菌悬液:甘油作为冷冻保护剂,抗生素抑制杂菌。
四、验证新制备对照的有效性
重新制备后,需通过以下实验确认对照有效性:
DN段:
标准PCR扩增,Ct值应在20~30之间(与旧对照一致);
琼脂糖凝胶电泳,条带亮度与内参基因(如β-actin)相当。
活菌悬液:
涂布平板后,24小时内长出密集单菌落(≥10⁶ CFU/mL);
PCR扩增目标基因,Ct值与DN段对照一致。