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公司新闻

污染微生物的分离实验

点击次数:1191发布时间:2018/1/19 10:20:31

样本的预处理:超净工作台无菌取样到已灭菌的具盖 15 mL 离心管中,1 600×g 离心 4 min 除去大量链霉菌菌体,上清液于 4 °C 保存。取上清液进行简单显微镜观察,判定样本中污染微生物的基本形态及种类,同时测定各样本中 ε-PL 的含量及 pH 值。

 污染微生物的分离:分别取 1 mL 4 °C 保存的上清液到 LB 液体培养基中进行富集培养,于 30 °C、200 r/min 培养。分别于 24、72 h 取富集培养液,10 倍稀释法稀释后取样涂布至牛肉膏蛋白胨及 LB 培养基上,3 个平行。同时分别取 4 °C 保存的上清液 10 倍稀释法稀释涂布在贝纳特、牛肉膏蛋白胨、LB 培养基上,37 °C 培养 48 h 观察菌落特征,并采用平板划线法进行纯化。

分类鉴定: 根 据 “Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology” (9th edition)细菌分类标准,借助光学显微镜、扫描电镜等对分离菌株的营养细胞进行观察,扫描电镜样品的预处理主要包括表面清洁、固定、漂洗和脱水等过程:(1) 用无水乙醇进行清洗,之后用 3%戊二醛溶液固定,再用四氧化二锇固定。(2) 干燥除去乙醇,减少表面张力对样品表面的影响。(3) 酒精梯度脱水之后,再用磷酸异戊酯过渡,干燥后用扫描电子显微镜观察。根据上述观察的形态特征,结合 16S rRNA 基因对分离得到的菌株进行鉴定。

分子鉴定:采用细菌基因组提取试剂盒抽提菌株总 DNA;用细菌通用引物 27F 和 1492R 对菌株总 DNA 进行 16S rRNA 基因扩增。PCR 反应使用 50 μL 体系:1 ng DNA 模板 3 μL,10×PCR mix 25 μL,5 U/μL Taq DNA 酶 0.5 μL,上下游引物 2 μmol/L 各 0.5 μL,ddH2O 20 μL 。PCR 程序为: 95 °C 10 min;94 °C 30 s,54 °C 30 s,72 °C 105 s,共 29 个循环;72 °C 10 min。PCR 结束后经琼脂糖凝胶电泳检测,符合测序要求后将 16S rRNA 基因片段送上海生工生物技术公司进行测序。利用 NCBI 中 BLAST 在线比对所测菌株的 16S rRNA 基因序列,将其与从 GenBank 数据库中获得的其他亲缘关系相近种属的 16S rRNA 基因,采用 ClustalX 2.0 软件进行多序列匹配排列(Multiple alignments),用系统发生推断软件包 MEGA 6.0 进行系统发育分析。在 Kimura-2-parameter 模型的基础上,用 Neighbor-Joining (N-J)法构建分子系统树,自举分析 (Bootstrap) 1 000 次重复检测分子系统树的置信度,缺失和不确定的位点在计算中被省略。

 分离菌株的验证:将分离菌株与 Streptomyces sp. M-Z18 按照摇瓶发酵工艺进行共培养,72 h 后平板划线培养观察菌落特征;将分离菌株于 M3G 培养基中培养 24 h 后分别接种 3 mL 到不同 pH 的 RSM 培养基中培养,考察其 pH 耐受性,培养 72 h 后 620 nm 下测定 OD。发酵污染一般在发酵中后期,此时发酵 pH 控制在 3.8,ε-PL 产量在 20 g/L 以上。为进一步验证分离菌株的聚赖氨酸耐受性,将其于 M3G 培养基中培养 24 h,取 3 mL 接种至分别含 12、24、36、48 g/L ε-PL pH 3.8 的 RSM 培养基中培养 72 h,再用培养液直接点接种平板观察是否有菌落生长。

Stevioside HPLC≥95% 甜菊苷 20mg/支
Gastrodin HPLC≥98% 天麻素 20mg/支
Ursolic acid HPLC≥98% 熊果酸 20mg/支
Arbutin HPLC≥98% 熊果苷 20mg/支
Synephrine HPLC≥98% 辛弗林 20mg/支
Coumarin HPLC≥98% 香豆素 20mg/支
p-Coumaric acid HPLC≥98% 对香豆酸 20mg/支
Tetrahydropalmatine 滴定法≥98% 延胡索乙素 20mg/支
 

菌

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