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病毒性出血性败血症病毒(VHSV)荧光 RT-PCR 检测试剂盒说明书
点击次数: 142发布时间:2018/1/23 10:36:25
- 上 传 者: 上海谷研实业有限公司
- 上传时间: 2018/1/23 10:36:25
- 文件大小: 33KB
- 文件类型: jpg
- 所属分类: 其它资料
- 下载次数: 279次
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资料简介: 1、 试剂盒简介
货号:HB-703-1
病毒性出血性败血症,是病毒性出血性败血症病毒(VHSV)感染所产生的一种弹状病毒性疾病,
该病毒易感宿主种类,包括很多海水和淡水养殖鱼类。易感鱼群各鱼龄阶段均可感染,鱼龄越小越
易发病死亡,亲鱼较少发病。该病传染性极强,能在一年四季流行,但是,通常发生于春季水温上
升或者波动时,易感动物主要为虹鳟、大菱鲆、日本牙鲆等。
为了适应病毒性出血性败血症病毒(VHSV)快速检测和疫病研究的需要,本公司参考 2015 年
OIE 水生动物疾病诊断手册 2.3.9 中规定的引物和探针序列,经多次实验及系统优化,开发生产了
本试剂盒。应用本试剂盒进行检测具有快速、灵敏、特异、准确、安全操作简单、应用广泛和高通
量检测等特点及优点。
2、 试剂盒组成
试剂盒组成包括核酸扩增试剂。具体组成参见表 1:
表 1:试剂盒组成(50test/盒)
试剂盒组成成分 体积
核酸提取试剂: 核酸裂解液 15ml×2 管
核酸扩增试剂: DEPC 水
VHSV 荧光 RT-PCR 反应液
酶混合物
阴性对照
VHSV 荧光阳性对照
1ml×1 管
750µL×1 管
60µL×1 管
1ml×1 管
1ml×1 管
(注:核酸提取试剂可使用本公司生产的提取核酸更快捷方便的《病毒 RNA 柱式提取试剂盒》)
3、 样本采集,存放及运输
3.1 样本采集:所用取样器材必须经高压灭菌并烘干。
取新鲜鱼类组织脏器(肝、脑、脾、肾)2g 于已洗净、灭菌并烘干的研钵中充分研磨,加 5ml PBS
混匀,2 000r/min 离心 10min 取上清转入无菌离心管中备用。或取有可疑细胞病变的细胞悬液用于检测。
3.2 存放:研磨后的样本在 2 ℃—8 ℃条件下保存应不超过 24 h;-70 ℃以下可长期保存,但应避免反复冻融(最多冻融 3 次)。
3.3 运输:采用冰壶或泡沫箱加冰密封进行运输。
4、 荧光 RT-PCR 检测
4.1 操作方法
4.1.1 样本的处理(在样本制备区进行):
4.1.1.1 取 n 个灭菌的 1.5 mL Eppendorf 管,其中 n 为被检样品、阳性对照与阴性对照的和(阳性
对照、阴性对照在试剂盒中已标出),做标记。
4.1.1.2 每管加入 600 µL 裂解液,分别加入被检样本、阴性对照、阳性对照各 200 µL,一份样本
换用一个吸头,再加入 200 µL 氯仿,混匀器上振荡混匀 5 s(不能过于强烈,以免产生乳化层,
也可以用手颠倒混匀),于 4℃ 12 000 r/min 离心 15 min。
4.1.1.3 取与 4.1.1.1 相同数量灭菌的 1.5 mL Eppendorf 管,加入 500 µL 异丙醇(-20℃预冷),
做标记。吸取 4.1.1.2 各管中的上清液转移至相应的管中,上清液应至少吸取 500µL,不能吸
出中间层,颠倒混匀。
4.1.1.4 于 4 ℃、12 000 r/min 离心 15 min(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),小
心倒去上清,倒置于吸水纸上,沾干液体(不同样品须在吸水纸不同地方沾干);加入 600 µL 75%
乙醇,颠倒洗涤。
4.1.1.5 于 4 ℃、12 000 r/min 离心 10 min(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),小
心倒去上清,倒置于吸水纸上,尽量沾干液体(不同样品须在吸水纸不同地方沾干)。
4.1.1.6 4 000 r/min 离心 10s(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),将管壁上的残余
液体甩到管底部,小心倒去上清,用微量加样器将其吸干,一份样本换用一个吸头,吸头不要
碰到有沉淀一面,室温干燥 3 min,不能过于干燥,以免 RNA 不溶。
4.1.1.7 加入 11 µL DEPC 水,轻轻混匀,溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 离心 5 s,冰上保存备
用。提取的 RNA 须在 2 h 内进行 PCR 扩增;若需长期保存须放置-70 ℃冰箱内。
【也可参照《病毒 RNA 柱式提取试剂盒说明书》(货号:HB-QPCR-01)使用,更方便快捷提取
核酸】。
注:提取的 RNA 须在 2 h 内进行 PCR 扩增;若需长期保存须放置-70 ℃冰箱内。
4.1.2 检测
4.1.2.1 扩增试剂准备(在反应混合物配制区进行):
从试剂盒中取出相应的荧光 RT-PCR 反应液、酶混合物,在室温下融化后,2000 r/min 离心 5 s。设所需荧光 RT-PCR 检测总数为 n,其中 n 为被检样品、阳性对照与阴性对照的和,每个样品测试反应体系配制见表 2:
表 2 每个样品测试反应体系配制表
试剂 RT-PCR 反应液 酶混合物
用量 15 μL 1.0 μL
根据测试样品的数量计算好各试剂的使用量,加入到适当体积试管中,充分混合均匀,向每个荧光RT-PCR管中各分装16 µL,转移至样本处理区。
4.1.2.2 加样(样本处理区进行):
在各设定的荧光RT-PCR管中分别加入上述样本处理步骤4.1.1.7中制备的RNA溶液各10 µL,盖紧管盖,500 r/min离心30 s。
4.1.2.3 荧光 RT-PCR 检测(在检测区进行):
将4.1.2.2中离心后的PCR管放入荧光RT-PCR检测仪内,记录样本摆放顺序。
循环条件设置:
第一阶段,反转录50 oC /30 min;
第二阶段,预变性95 o
C/15 min;
第三阶段,94 o
C/15s,60 o
C/40s,72 o
C/20s,40个循环,在第三阶段每次循环的60 o
C退火延
伸时收集荧光。
试验检测结束后,根据收集的荧光曲线和Ct值判定结果。
4.2 结果判定
4.2.1 结果分析条件设定
直接读取检测结果。阈值设定原则根据仪器噪声情况进行调整,以阈值线刚好超过正常阴性样品扩增曲线的最高点为准。
4.2.2 质控标准
4.2.2.1 阴性对照无 Ct 值或无扩增曲线。
4.2.2.2 阳性对照的 Ct 值应<28.0,并出现典型的扩增曲线。否则,此次实验视为无效。
4.2.3 结果描述及判定
4.2.3.1 阴性
无Ct值或无扩增曲线,示样品中无VHSV核酸。
4.2.3.2 阳性
Ct值≤30,且出现典型的扩增曲线,示样品中存在VHSV核酸。
4.2.3.3 有效原则
Ct值>30的样本建议重做。重做结果无数值者为阴性,否则为阳性。
5、 相关技术信息(引物和探针序列)
Forward primer: 5’-AAA-CTC-GCA-GGA-TGT-GTG-CGT-CC-3’,
Reverse primer: 5’-TCT-GCG-ATC-TCA-GTC-AGG-ATG-AA-3’,
and probe: 5’-FAM-TAG-AGG-GCC-TTG-GTGATC-TTC-TG-BHQ1.
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