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技术文章
新发现：RNA可变剪接在造血干细胞发生中的作用
点击次数：3809 发布时间：2022/1/13 13:28:25
RNA剪接（RNA splicing）是指从DNA模板链转录出的初转录产物中除去内含子，并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。
RNA剪接机制的研究 ，是80年代生物化学和分子生物学域中有生机的研究课题之一，它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题，而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化问题都是有力的推动。
另外，核酸分子的催化功能的发现拓宽了人们对于酶的认识。
造血干细胞发生过程中的RNA可变剪接
近日，发表在《Science Advances》上的一篇名为：“Single-cell architecture ａnd functional requirement of alternative splicing during hemaoietic stem cell formation”的文章，揭示了造血干细胞发生过程中的RNA可变剪接。
第YI个造血干细胞(HSCs)产生于哺乳动物胚胎发育期间的主动脉-性腺-中肾(AGM)区域。血统追踪和实时体内观察表明，造血干细胞来自于造血内皮细胞(HECs)，这是一种沿背主动脉腹壁的短暂群体。
近，这些细胞被分离出来，并以单细胞转录组学为基础，绘制了小鼠HSC发育全程的RNA剪接图谱，并对内皮细胞向造血细胞的转变（EHT）过程中，出现的关键可变剪接（alternative splicing, AS）及其上游调控因素进行探究，鉴定出Srsf2因子——通过调控造血细胞特异性AS事件促进HSC发生的新机制。
结果1
从AS角度解析T1 pre-HSC所呈现的为显著的转录本多样性：
- AS频率在T1 pre-HSC时期到达dian峰，与显著的转录本多样性一致。
结果2
EHT期间转录异构体丰度的功能相关差异：
- 84%的HEC和73%的T1 pre-HSC特征亚型(signature isoforms)是蛋白质编码转录本，负责各种RNA代谢过程相关功能。
结果3
一系列AS事件介导了EHT中的转录多样性：
- 与AECs相比，“剪接体”途径的基因表达在HEC中更为丰富。
结果4
血源特异性包括AS事件是可在体内检测到的，是体外造血细胞生成所必需的。
结果5
Srsf2在内皮阶段的缺失会破坏EHT。
结果6
Srsf2协调造血特异性AS事件：
- Srsf2通过调节EHT过程中关键基因的剪接模式，从而在HSC发生中发挥作用。
这项研究中，用到了RNA FISH、qPCR等高精度分子实验，这些实验比较容易收到外源DNA、RNA的干扰，因此，为了bao证实验的准确性，如何祛除外源干扰，十分关键。
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原创作者：北京缔一生物科技有限公司
