标题：《2024年江门市甲型流感病毒全基因组序列的特征性分析》

摘要：

目的:对2024年江门市甲型流感病毒进行分子遗传特征分析，评估与疫苗株的匹配情况，为流感疫苗接种及流感防控策略提供实验室依据。方法:选取2024年不同月份江门市流感网络实验室检测为阳性的5株A/H1N1pdm2009和5株A/H3N2流感病毒样本，使用犬肾(MDCK)细胞培养病毒并收集病毒培养物进行核酸提取，对提取的病毒核酸进行全基因组高通量测序，以WHO推荐的当年疫苗株为参考对甲型流感病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)基因进行遗传进化关系分析，并对其氨基酸位点、糖基化位点等进行分子特征分析，再用AlphaFold3预测蛋白结构。结果:(1)5株A/H1N1pdm2009分离株均属5a.2a遗传分支，5株A/H3N2分离株均属2a.3a.1遗传分支。(2)A/H1N1pdm2009分离株HA蛋白4个抗原决定簇上发生位点变异，提示流行强度会加强，其他抗原变异位点有发生变异但不出现在关键位点上，与疫苗株同源性相似度达97%以上；A/H3N2分离株HA和NA蛋白的变异并没有发生在关键位点上，与疫苗株同源性相似度达98%以上。(3)5株A/H1N1pdm2009分离株HA蛋白糖基化位点发生改变，4株A/H1N1pdm2009分离株NA蛋白糖基化位点发生变化；5株A/H3N2分离株HA和NA蛋白均未发生糖基化位点的改变。结论:2024年江门市甲型流感病毒分离株与疫苗株整体匹配性较好，但氨基酸关键位点和糖基化位点存在一定程度变异，今后有必要持续加强分子进化特征监测从而了解流感流行的风险，以及评价基因变异对流感疫苗和医院用药效果的影响。

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