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技术文章

浙江大学医学院发现:替代Cas9的基因组编辑新技术

点击次数:3872 发布时间:2017/10/11 9:52:59

替代Cas9的基因组编辑新技术
来自浙江大学医学院的研究人员报告称,他们证实可以利用格氏嗜盐碱杆菌(Natronobacterium gregoryi)的Argonaute来实现DNA引导的基因组编辑。这一重要的研究成果发布在5月2日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。

领导这一研究的是浙江大学医学院与工程学院生命科学系的韩春雨(Chunyu Han)副教授。其主要研究方向为真核基因表达调控,特别是和肿瘤相关的基因。此外,还有表观遗传相关蛋白,RNA的功能研究,例如,长非编码RNA的功能及其他。

RNA引导的核酸内切酶Cas9是最常用的基因组编辑工具,其利用了RNA-DNA杂合来特异性地切割基因组序列。尽管研究人员已设法对Cas9系统进行多次改造来提高它的效率和特异性,它对向导序列-靶序列错配的容忍以及向导RNA相对容易形成二级结构限制了Cas9-sgRNA系统的实用性。

Argonautes是一个核酸内切酶家族,其利用5′磷酸化的短单链核酸来作为向导切割靶序列。与Cas9相似,Argonautes在基因表达抑制及抵御外源核酸中起关键作用(CRISPR先驱发表最新研究成果 )。然而,Argonautes在许多方面不同于Cas9。Cas9只存在于原核生物中,而Argonautes在进化过程中保守,存在于几乎所有生物体中;尽管大多数的Argonautes结合单链(ss)RNAs,在RNA沉默中起重要作用,一些Argonautes却可以结合ssDNAs并切割靶DNA;正确的Cas9结合要求向导RNA必须有一个3′RNA-RNA杂化结构,而Argonaute结合则不要求特异的一致的向导RNA二级结构;Cas9只可以切割PAM上游的靶序列,而Argonaute不要求靶序列上存在特异的序列。当Argonaute与向导序列结合时,它们可以影响彼此的生物化学特性,并作为一个整体起作用。由于以上这些特征,Argonautes已进化为一个能够执行许多不同任务的大蛋白质家族。

在这篇Nature Biotechnology文章中作者报告称格氏嗜盐碱杆菌Argonaute (NgAgo)是一种适合用于人类细胞中实现基因组编辑的DNA引导核酸内切酶。NgAgo可结合大约24核苷酸大小的5′磷酸化单链向导DNA (gDNA),有效地生成位点特异性的DNA双链断裂。这一NgAgo–gDNA系统不需要PAM,初步的特征描述表明它对向导序列-靶序列错配低容忍,且能够高效地编辑富含G+C的基因组靶序列。因此,NgAgo–gDNA系统是在哺乳动物细胞中实现基因组编辑的一种精确、有效的工具。

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