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心得分享：如何查找特定基因序列 岑特新闻√
点击次数：3447 发布时间：2019/12/19 9:27:47
如何查找特定基因序列的心得与大家共享，下面以小鼠EDNRB基因为例子说明：
1. 查找一个基因的启动子之前，最好是要对这个基因做一个初步的了解
注意：在research下面选择 Gene 在for后面输入ednrb
2. 这个是查找结果，由于很多哺乳类动物都有该基因，查找结果显示了很多五种的ednrb基因，我们选择其中的Mus musculus 这个是我们要找的小鼠种类，请大家正确选择自己目标基因的动物种类，Rattus norvegicus是大鼠的学名，Mus musculus是小鼠的学名，由于我的目标是小数的ednrb基因，故选择Mus musculus。
3: 对Official Symbol Ednrb ａnd Name: endothelin receptor type B [Mus musculus]
Other Aliases: AU022549, ET-B, ET>B<, ETb, Sox10m1, s
Other Designations: piebald
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
解释：Official Symbol Ednrb ａnd Name 这个是官方对这个基因的全称，也就是内皮素受体B 这个是该基因编码的蛋白质名称
Other Aliases 该基因的别名
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM 说明该基因位于第14条染色体上面
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
这个说明基因的碱基分布是104213843到104242913.
4. 该基因的具体信息
5. 以上部分是找到对该基因的基本信息，在最下面Reference assembly (C57BL/6J)上面找到基因具体序列的链接，点击其中的GenBank， ednrb基因碱基的排列就出来了，这里说明 一下，genbank上面给的序列都是与相应mRNA互补的序列，也就是模板链的序列，也就是-（minus strand) 上面的C57BL/6J是得出该序列的小
原创作者：上海岑特生物科技有限公司
