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质粒中量抽提试剂盒使用说明
质粒中量抽提试剂盒使用说明:
使用说明:
1.
取过夜菌至3个1.5毫升离心管中,5000g离心1分钟收集细菌沉淀,弃上清。再重复一次,每管共收集3毫升过夜菌沉
淀。
通常大抽杆菌宜用LB培养过夜(16小时左右)至OD值为2-4。建议5000g(通常为5000rpm左右)室温离心1分钟,如沉淀不充
分则适当延长离心时间。时间过长或离心速度过快会使沉淀过于紧密,不利于加入溶液I后散开沉淀。直接倒掉上清,再
倒入约1.5毫升菌液并重复上述操作,然后倒置于吸水纸上(可用普通草纸),使液体流尽。如果细菌密度明显偏低,可考
虑使用更多菌液,再重复上述操作1-2次。对于高拷贝质粒所用菌量每管一般不能超过5毫升,对于低拷贝质粒所用菌量
每管一般不能超过10毫升。过量的菌会导致后续的裂解不充分。
2.
每管加入250微升溶液I,重悬细菌沉淀。确保沉淀完全散开,无可见细菌团块。
确认溶液I中已经添加了RNase A。最高速度vortex 5-10秒或更长时间,悬起沉淀。一定要充分混匀,对着光亮处观察应呈
均匀的悬浊液,无明显细菌团块或絮块。如果没有vortex,可以用枪吹打沉淀使沉淀逐渐散开或用手指把沉淀弹开。
3.
每管加入250微升溶液II,轻轻颠倒离心管4-6次,使细菌完全裂解,溶液透明。
切勿vortex!vortex或其它剧烈操作会导致基因组DNA断裂,易导致最终所得质粒被基因组DNA污染。颠倒4-6次后,溶液
应变得透明,无团块或絮状物。如果加入溶液I后细菌没有完全散开,那么颠倒4-6次后,可能还会有团块或絮状物。遇到
有少量团块或絮状物产生的情况,可以增加颠倒次数3-5次,再室温放置2-3分钟,但总裂解时间不可超过5分钟。
4.
每管加入350微升溶液III,随即颠倒离心管4-6次混匀,可见白色絮状物产生。
切勿vortex!颠倒次数也不宜过多,否则易导致最终所得质粒的质量下降。
5.
最高速(13,000rpm左右)室温离心10分钟。
离心后会产生白色沉淀。离心时准备好下一步需使用的质粒纯化柱,废液收集管,并在纯化柱上做好标记。
6.
将上一步骤离心后的上清倒入或吸入到质粒纯化柱内。最高速离心30-60秒,倒弃收集管内液体。再重复两次,使三管
质粒结合于同一纯化柱上。
质粒倒入质粒纯化柱后,可以不用等待,直接离心。倒弃收集管内的液体后,保留收集管继续使用。
7.
在质粒纯化柱内加入750微升溶液IV,最高速离心30-60秒,洗去杂质,倒弃收集管内液体。
加入溶液IV后可以不用等待,直接离心。倒弃收集管内的液体后,保留收集管继续使用。
8.
最高速再离心1分钟,除去残留液体并使痕量乙醇完全挥发。
注意:倒弃收集管内液体后再离心,才能彻底去除微量的溶液IV。微量的溶液IV会影响质粒的质量。
9.
将质粒纯化柱置于1.5毫升离心管上,加入120微升溶液V至管内柱面上,放置1分钟。
溶液 V 需要直接加至管内柱面中央,使液体被纯化柱吸收。如果不慎将溶液 V 沾在管壁上,一定要震动管子,使液体滑
落到管底,以被纯化柱吸收。也可以用重蒸水或 MiliQ 级纯水替代溶液 V,但是水的 pH 应不小于 6.5。溶液 V 加入后放
置时间稍长,对于增加质粒产量会略有帮助。
10. 最高速离心1分钟,所得液体中加入600微升溶液VI,混匀后加到原质粒纯化柱内。
加入溶液VI后必须混匀!可vortex或颠倒混匀,混匀后切勿离心。
11. 最高速离心30-60秒,倒弃收集管内液体。
12. 在质粒纯化柱内加入750微升溶液IV,最高速离心30-60秒,洗去杂质,倒弃收集管内液体。
加入溶液IV后可以不用等待,直接离心。倒弃收集管内的液体后,保留收集管继续使用。
13. 最高速再离心1分钟,除去残留液体并使痕量乙醇完全挥发。
注意:倒弃收集管内液体后再离心,才能彻底去除微量的溶液IV。微量的溶液IV会影响质粒的质量。
14. 将质粒纯化柱置于1.5毫升离心管上,加入120微升溶液V至管内柱面上,放置1分钟。
用1.5毫升离心管作为收集管。溶液V需要直接加至管内柱面中央,使液体被纯化柱吸收。如果不慎将溶液V沾在管壁上,
一定要震动管子,使液体滑落到管底,以便被纯化柱吸收。也可以用重蒸水或MiliQ级纯水替代溶液V,但是水的pH应不
小于6.5。溶液V加入后放置时间稍长,对于增加质粒产量会略有帮助。如想得到较高浓度的质粒,可以加入80微升溶液V
洗脱。
15. 最高速离心1分钟,所得液体即为转细胞级超纯质粒。
通常所得质粒浓度为0.1-0.3mg/ml左右。如果想得到高浓度的质粒,可以采用常规的乙醇沉淀方法浓缩质粒。
注意事项:
第一次使用前把试剂盒提供的RNase A全部加到溶液I (悬浮液)中,混匀,并在瓶上做好标记。加入RNase A后4℃存
放。
第一次使用前在每瓶溶液IV (洗涤液)中加入54ml无水乙醇,混匀,并在瓶上做好标记。
温度较低时,溶液II和溶液III可能会有沉淀产生。使用前必须检查一遍。如有沉淀,37℃水浴加热溶解,混匀后使用。溶
液II请勿过分剧烈混匀,否则会产生大量气泡。
溶液II使用完后,一定要盖紧瓶盖,防止被空气中二氧化碳酸化。
溶液II有强碱性,溶液II、溶液III和溶液VI对人体都有刺激性,操作时请小心,并注意适当防护。
本试剂盒所有操作均在室温进行,操作时无需冰浴。所有离心也均在室温进行。
废液收集管在一次抽提中需多次使用,切勿中途丢弃。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
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