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实测横评|凡知FFPE DNA提取试剂,高核酸得率助力下游实验提质增效

点击次数:49 发布时间:2026/7/30 15:35:32
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FFPE 石蜡包埋组织是临床病理、肿瘤回顾性研究的珍贵样本库,海量存档蜡块蕴藏关键疾病分子信息。但甲醛交联、核酸降解、杂质残留三大难题,常年让实验人头疼:提取DNA总量低、片段破碎、qPCR扩增效率差,大量珍贵样本白白浪费。





本次我们选取市面两款竞品试剂盒,与凡知FFPE DNA提取试剂盒开展平行对照实验,从DNA提取总量、片段完整性、qPCR扩增性能三大维度完整实测,数据直观对比,看看谁才是FFPE样本提取解。


提取总量:凡知是竞品的3倍!



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💡亮点:凡知的Qubit浓度(80.0ng/μL)显著高于两款竞品。值得注意的是,凡知的NanoDrop浓度/Qubit浓度比值(N/Q)仅为1.14-1.15,远低于竞品1(2.08-2.11)和竞品2(2.92-3.10)。


这说明凡知提取的DNA中双链DNA占比更高,这更有利于下游二代测序(其测序流程主要基于双链DNA)。

💡结论:凡知试剂盒的提取总量(按照Qubit浓度计算)分别是竞品1的2.8倍、竞品2的3.7倍!这意味着同样的FFPE样本,凡知能回收更多DNA,对于珍贵的临床样本来说,这无疑是一个巨大的优势。

琼脂糖凝胶电泳:条带更亮、更完整

按Nano浓度1500ng跑胶,电泳图顺序:D2000、竞品1-重复1、竞品1-重复2、竞品2-重复1、竞品2-重复2、凡知-1、凡知-2、D15000。

按NanoDrop浓度1500ng上样,电泳结果显示:

  • 凡知样本条带更亮 → 说明实际DNA含量更高

  • 条带更完整 → DN段化程度更低,完整性更好


这对于下游的NGS测序、SNP分型等应用至关重要!


qPCR验证:CT值更低,灵敏度更高

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DNA体系配制:
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按Qubit浓度计算,投入200ng样本
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实验结果:
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💡关键发现:凡知两组CT值均低于竞品约0.7~0.8个循环。


在qPCR中,CT值每降低1个循环,代表模板量约增加1倍。凡知在相同投入量下CT值更低,说明其提取的DNA可扩增性更好——这对于FFPE样本中常见的DNA损伤修复和PCR抑制物去除能力是一个强有力的证明,在DNA质量和完整性方面显著优于测试的两个竞品。


综合实测总结,三大硬核优势


凡知FFPE DNA提取试剂盒,三大维度领先:

    总量优势:

    通过优化洗脱策略,总得率可达竞品3倍,最大化珍稀样本利用率;

    质量优势:

    电泳显示片段完整,降解程度最低,满足长片段检测需求;

    应用优势:

    qPCR CT值更低,表明抑制剂去除,扩增效率更高。


    组织石蜡切片DNA提取试剂盒

    (磁珠法)




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    海量存档FFPE蜡块是肿瘤机制研究、回顾性临床分析的核心资源,而一套高性能提取试剂盒,是释放样本价值的道关口。


    本次横向对照实验证明,凡知 FFPE DNA 提取试剂盒在真实产量、核酸完整性、下游扩增适配性表现出了硬核优势,不管是高校科研实验室,还是临床分子病理检测平台,都能大幅提升实验成功率,降低珍贵样本损耗。


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    原创作者:北京凡知医学科技有限公司

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