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大小鼠遗传质量鉴定
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实验动物简介
实验动物是具有明确遗传背景并严格遗传控制的动物,是人类医学研究的重要工具之一,包括小鼠、大鼠、猴、兔、犬、猪、鸡、地鼠、猫和豚鼠等多个物种,其中小鼠和大鼠为常用的实验动物。
根据遗传特点的不同,实验动物分为近交系、封闭群和杂交群
常用的大小鼠近交系、封闭群
大小鼠遗传质量鉴定
实验动物具有明确遗传背景,并需要进行遗传控制,否则遗传因素会干扰实验结果。很多生命科学的研究,要求实验动物的遗传结构有较高的同一性、稳定性和纯合度。这就提出了实验动物的遗传质量和监测的问题。每年进行遗传质量鉴定是非常必要的。导致实验动物不合格的主要是以下3个方面:
1.在繁殖饲养过程中,多个不同品系混养,可能会发生错误标记;
2.自身突变积累,导致遗传特性渐渐与早期世代品系有差异;
3.封闭群繁育过程中,亲本选配组合不当造成近交化。
现行的实验动物遗传质量控制的国家标准为《GB14923-2010 实验动物 哺乳类实验动物的遗传质量控制》,国标中规定了实验动物近交系和封闭群需定期(每年一次)进行遗传检测,确保遗传质量。
国标GB14923-2010提及的遗传质量检测方法
目针对大小鼠遗传质量鉴定,除了国标GB14923-2010外,主要参考中国实验动物学会团体标准《T/CALAS21-2017 实验动物 小鼠、大鼠微卫星DNA标记检测方法》。该团体标准由中国实验动物学会实验动物标准化业委员会提出并组织,由中国食品药品检定研究院、都医科大学和浙江省医学科学院共同起草完成。该标准明确规定了大小鼠遗传质量鉴定的STR方案。新国标制订计划《实验动物 近交系小鼠、大鼠SNP标记检测法》已经于2020年11日19日下达,并由中国食品药品检定研究院和上海实验动物研究中心共同起草,目处于起草阶段。
多重PCR&二代高通量测序助力小鼠遗传质量鉴定
针对小鼠近交系和封闭群,从国际标准Jackson实验室2000个SNP位点中选择出150个SNP位点,采用多重PCR扩增建库技术结合二代高通量测序进行SNP基因分型,并自写软件与Jackson数据库进行比对。选择后的150个SNP标记,可准确鉴别所有近交系小鼠,品系两两间关系近的相差3个SNP,关系远的相差73个SNP,差异位点平均数为53个。选择后,大幅度降低成本的同时确保了鉴定结果准确性。
多重荧光PCR&ABI3730平台STR基因分型助力大鼠遗传质量鉴定
Biowing大鼠近交系和封闭群的遗传质量鉴定服务,参照团标《T/CALAS21-2017 实验动物 小鼠、大鼠微卫星DNA标记检测方法》提供的STR引物方案,结合多重PCR技术优势,进行多重荧光PCR法STR分型,获得样本STR分型后,利用遗传学分析软件计算群体遗传参数,依据团标T/CALAS21-2017的标准判断大鼠近交系和封闭群是否合格。
送检流程与周期
大小鼠遗传质量鉴定检测周期:2-3周。
原创作者:上海松茸生物科技有限公司

