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DpnI处理及回收
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当模板质粒是从大肠杆菌提取的已甲基化的质粒,可采用Dpn I酶切方法清除模板(DpnI特异切割甲基化过的序列,细菌来源的质粒会被切碎),最后产物中无模板中的完整质粒,让后面转化过程中的阴性背景降至最低。
NEB buffer 4 5μl
NEB的Dpn I 1μl
PCR产物 45μl
37度温育2小时。
2.PCR产物回收(所有步骤均在室温下进行)
A.将PCR产物转入1.5ml 离心管中,加入4-5倍体积的Buffer CP(如果PCR产物片段小于200bp,应该加6倍体积的Buffer CP)。
B.斡旋混匀,短暂离心将溶液从管盖及壁上离心下来。
C.取HiBind DNA柱子放入2ml收集管中。
D.将混匀的样品加入柱子中,10000g离心1分钟,去掉收集管中的溶液(由于柱子一次只能容纳700μl溶液,如果溶液大于700μl,可以在这一步分两次离心)。
E.加700μl DNA Wash Buffer(使用前确认该溶液已按比例用酒精稀释过,如果冬天进行实验,DNA Wash Buffer可能因温度过低有沉积,需升温溶解上下颠倒混匀后才可使用),10000g 离心1 分钟。
F.去掉收集管中的溶液,重复步骤5。
G.去掉收集管中的溶液,13000g离心2分钟(离心完后确认Hibind Miniprep column侧壁底部有无溶液,如有,应该用细长滤纸或10ul枪头吸干净后再离心一次)。
H.将柱子放入干净的离心管中,加入30-50μl Elution buffer或双蒸水(如果长期保存,建议加入Elution buffer),静置2分钟,13000g离心1分钟收集质粒。
I.琼脂糖电泳检测或通过测A260来估算浓度: 质粒DNA= A260X50X(稀释倍数)ug/ml。
3.胶回收(所有步骤均在室温下进行)
琼脂糖电泳PCR产物,由于需要切胶回收PCR产物,所以要用新的电泳缓冲液。
A.长波长紫外线下观察DNA,并用干净刀片切下条带。不要将胶长时间暴露于紫外光下,以免在DNA上产生缺刻或双链缺口,尽量不切多余的不含目的条带的胶。
B.将切下来的胶放入干净的1.5ml 离心管中称重,按每ml胶重1g算出胶融化后的体积(即,如果重0.3g,那么溶解后为0.3ml),加入等体积的Binding Buffer,55-60℃ 孵育7min左右直至胶完全溶解,上下颠倒混匀。
C.取一个HiBind DNA柱子放入2ml收集管中。
D.将溶化后的凝胶与binding buffer混合液加入到柱子中(柱子的容量为700μl,如果体积大于700μl可分几次离心,但每个柱子的载量仅为25μg DNA,如果预期产量不止25μg DNA,可根据载量分装到几个柱子中回收),10000g离心1分钟,倒掉收集管中的溶液。
E.再加300ul Binding Buffer到柱子中,10000g离心1分钟,倒掉收集管中的溶液。
F.在柱子中加入700μl SPW Wash Buffer(使用前确认该溶液已按比例用酒精稀释过,如果冬天进行实验,SPW可能因温度过低有沉积,需升温溶解上下颠倒混匀后才可使用),倒掉收集管中的溶液。
G.重复步骤7.
H.13000g离心2分钟(离心完后确认Hibind Miniprep column侧壁底部有无溶液,如有,应该用细长滤纸或10ul枪头吸干净后再离心一次)。
I.将柱子放入干净的离心管中,加入30-50μl Elution buffer或双蒸水(加入时应该加在滤膜中央,但又要避免枪头碰到滤膜,以免戳穿。另,如果长期保存,建议加入Elution buffer),静置2分钟,13000g离心1分钟收集PCR回收产物。
J.琼脂糖电泳检测或通过测A260来估算浓度: 质粒DNA= A260X50X(稀释倍数)ug/ml。
原创作者:武汉博欧特生物科技有限公司


