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遗传学新技术

点击次数：186 发布时间：2016/8/16 13:17:48

理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的，不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序（ChIP-seq）近来在这一领域取得了一定进展，但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。

研究人员开发了两项新技术，RP-ChIP-seq（recovery via protection -ChIP-seq）和FARP-ChIP-seq（favored amplification RP-ChIP-seq）。这两项技术只需500个细胞就能进行可靠的表观基因组分析。

研究显示，RP-ChIP-seq可以在一个小鼠晶状体中检测衰老相关的表观遗传学改变。而FARP-ChIP-seq能够在小鼠的长期造血干细胞（long-term HSC）、短期造血干细胞（short-term HSC）和多能前体细胞（MPP）准确地同时定位组蛋白修饰H3K4me3和H3K27me3。

在细胞分化过程中，H3K4me3/H3K27me3双修饰的二价状态，会变成H3K4me3或者H3K27me3单修饰状态，进而调控基因的表达情况。这项研究表明，HSC中的造血分化基因缺乏H3K4me3/H3K27me3二价状态。