编写白血病“基因组传记”

一项新研究，让我们看到了结合大批白血病组织样本的基因组收集到的丰富信息。

通过分析来自500多名患者慢性淋巴细胞白血病(CLL)组织和正常组织的遗传材料，研究人员鉴别出有数十个遗传异常有可能驱动了这一疾病，其中有两个以往从未发现与人类癌症有关。他们着手追踪了一些异常影响疾病过程以及治疗敏感性的机制。并着手追踪了在患者体内随着不断搅动的基因组造成新的肿瘤细胞群及亚群，CLL的进化路径。

随着CLL的治疗日益与每位患者肿瘤的独特遗传特征联系起来，这类信息至关重要。现在靶向癌细胞内一组特异过失基因的药物正作为传统化疗方案的补充（延伸阅读：PNAS：血癌的双重推手 ）。

新研究中，我们想确定分析来自接受相似治疗的一大群患者的组织样本，是否可以提供在所有遗传多样性中研究这一疾病必需的统计强度——确定某些突变与疾病侵袭性之间的联系，绘制出新突变出现的图表及它们在帮助疾病进展中所起的作用。我们的研究显示了通过这种方法可获得的认识范围。

研究还让我们看到了下一阶段的大规模基因组测序工作可能会是什么样子。样本大小日益增大使得我们能够开始深入地解读个体肿瘤中不同突变之间的复杂互作，以及重建获得这些突变使得恶性肿瘤能够旺盛生长及战胜治疗的进化轨迹。

某些基因突变在已接受治疗的患者肿瘤组织中尤为常见，表明这些突变帮助了疾病在初始治疗后复发。通过确定哪些突变往往在疾病早期或晚期出现，编译出了CLL“分子传记”草图。他们还发现一些突变往往成对出现，一个接着另一个。研究人员发现，在肿瘤携带着TP53或SF3B1基因突变的患者中治疗带来的缓解期往往较短。

通过比较治疗和复发后收集的肿瘤样本，我们发现治疗后的基因组进化比预期的规则。一些突变存在于一个复发后样本大量的白血病细胞中，表明这些突变有可能使得肿瘤得以维持下去。

研究结果的宽度表明了在系统测序及分析大群临床状态确定的肿瘤组织样本时能够获得什么。我们的研究工作让我们发现了一些新癌症基因，着手绘制出CLL的进化路径，证实一些特异的突变影响了患者对治疗的反应。这些研究发现将为CLL和其他肿瘤类型的精准治疗奠定基础。